薛己家居医录十六卷【字新甫，号立斋，吴人，铠子，正德间选为御医，擢南京太医院判，进院使。】
徐鲁源医录原旨□卷【无锡人。】
龚信古今医鉴八卷
何继高轩岐新意一卷
冯鸾医学大成七卷，又医说补遗一卷
白飞霞韩氏医通一卷
蒋达善医镜二十卷【常州人。】
芮养谦医经原始，又医学发明
闵守泉医学类纂【俱直隶太平府人。】
钱萼医林会海四十卷【嘉善人。】
邵弁医学纲目四十卷，又十二经络发挥
张浩仁术便览四卷【万历初人，乙酉王再聘序。】
李烶医学入门七卷
费杰名医钞【字世彦，浙江山阴人。】
方隅医林绳墨八卷
罗周彦医宗粹言十四卷
张受孔医便五卷【休宁人。】
解祯医学便览四卷
徐常吉古今医家经论汇编五卷
彭用先体仁汇编十卷
朱懦医四书□卷【秀水人，万历初太医院使，尝谏神宗戒暴怒以平气，寡嗜欲以养精，神宗纳之，令中官陆敬书其语于屏。】
黄维亮医林统要四卷
赵金医学经略【乌程人。】
刘起宗名医三要三卷
陈朝璋扶生堂医书【临川人，万历中选贡，常州府通判。】
王肯堂证治准绳八卷，又王氏医论四卷
缪希雍广笔记二卷【字仲淳。】
傅懋先医宗正脉五卷
周伦医略四卷
赵献可赵氏医贯六卷【字养葵，宁波人。】
黄承昊折肱漫录六卷，又评注薛氏内科医案三卷附方一卷【字闇斋，秀水人，洪宪子，万历丙辰进士，工科左给事中，历福建按察使。】
万全保命活诀三十五卷【罗田人。】
喻昌医门法律【字嘉言。】
喻昌寓意草一卷【崇祯癸未自序。】
李中梓颐生微论十卷
毕懋襄医荟十八卷【字君平，歙人。】
缪氏识病捷法十卷【字仲淳。】
孙志宏简明医彀八卷【字克容，杭人，崇祯己巳自序。】
黄图玄机保命书四卷
王世相声开七卷
马元仪津梁八卷【门人姜思吾校，称马师津梁。】
李濂医史十卷
周恭增校医史四卷，又医效日钞四卷
程伊医林史传四卷，又史传拾遗一卷，又医林外传四卷
陈桷注石山医案三卷【一作许忠注，九卷。】
赵铨石亭医案
江瓘名医类案十二卷
周普兰谷医案□卷，又兰谷用药歌诀一卷
钱宝医案四卷
汪昂灵素类纂【休宁人，杭补。】
杨珣针灸详说二卷
姚良考古针灸图经【字长卿，吴人。】
解延年经穴图解
汪机针灸问对二卷
徐凤徐氏针灸六卷，又针灸大全七卷
徐师曾经络全书
孝宗皇帝类证本草三十一卷
徐彦纯本草发挥四卷【山阴人，朱丹溪弟子。】
沈宗学本草发挥精华
杨溥用药珍珠囊诗括二卷【溥系狱时，括为韵语，以便诵读捡药。】
熊宗立原医图药性赋八卷
解延年本草集略
王纶本草集要八卷
方谷本草集要十二卷
徐彪本草证治辨明十卷【字文蔚，华亭人，正德中太医院判。】
滕弘神农本经会通十卷【瓯宁人。】
徐东齐本草权度三卷
汪颖食物本草二卷【江陵人，正德中官九江知府，本卢和所为，书而成之。】
甯源食鉴本草一卷【镇江人。】
汪机本草会编二十卷
吴源食品集二卷附录一卷【吴江人。】
汪昂本草备要【杭补。】
陈嘉谟本草蒙筌十二卷【字廷采，嘉，隆间祁门医士。】
李时珍本草纲目五十二卷【字东璧，蕲州人，楚府奉祠，时珍辨疑订误，肆力者四十年，始成其书，分一十六部，部各有类，增药三百七十四种，万历二十四年子诸生李建元进于朝，命宣付史馆。】
许希周药性粗评四卷
梅得春药性会元三卷
李中梓