丁酉（二十八日），赠澎湖阵亡左都督平阳总兵官朱天贵太子少保，准一子为荫生。
八月壬子（十三日），福建水师提督施琅奏：『七月十五日，郑克塽遣伪官冯锡珪等，伪侯刘国轩、伪伯冯锡范遣其弟伪副使刘国昌、冯锡韩等赍降表文稿诣臣军前，请缴伪册印，率众登岸，以求安插。臣随遣侍卫吴启爵、笔帖式常在同冯锡珪等持榜示往台湾晓谕伪官兵民，验视薙发；即令郑克塽等缮写降表，并伪册印一并赍送，以便代奏。至台湾虽在海外，地方千余里、户口数十万；或弃、或守，伏候上裁』。得旨：『海洋远徼，尽入版图；积年逋寇，悉皆向化：具见卿筹划周详、剿抚并用，克奏肤功，朕心深为嘉悦！在事有功人员，该部一并从优议叙；余令议政王大臣会议以闻』。寻议：『台湾应弃、应守，俟郑克塽等率众登岸，令侍郎苏拜与该督、抚、提督会同酌议具奏』。从之。
戊辰（二十九日），福建水师提督施琅奏：『臣于八月十一日，率领官兵自澎湖进发；十三日，入鹿耳门，至台湾。十八日，郑克塽及文武官俱已薙发；宣读敕诏，郑克塽等欢呼踊跃，望阙叩头谢恩。所有郑成功之子伪辅政公郑聪等六人，郑锦之子郑克塽及其弟伪恭谨侯郑克塽等九人，伪武平侯刘国轩、伪忠诚伯冯锡范等子弟及明裔朱桓等十七人，并续顺公下官兵家口、海澄公家口，俱拨船配载，官兵陆续护送，移入内地；并移咨侍郎苏拜及督，抚，听其安插。其余伪文武各官家口，见在趣令起行；兵丁有愿入伍及归农者，听其自便。至于江浙、闽、粤各省被获男妇，臣仰体皇仁，已悉令回籍。其册印、扎付，已次第追缴；仓库人民户口册籍、船艘军器，俱令巡海道线一信等察收』。下所司知之。
九月戊寅（初十日），谕吏部、兵部：『向来海寇窜踞台湾、出没岛屿、窥伺内地，扰害生民。虽屡经剿抚，余孽犹存；沿海地方，烽烟时警。迩者黔、滇底定、逆贼削平；惟海外一隅，尚梗王化。爰以进剿方略咨询廷议，咸谓海洋险远、风涛莫测，长驱制胜，难计万全。朕念海氛未靖，则沿海居民勿获休息；特简施琅为福建水师提督，前往相度机宜，整兵进征。该提督忠勇性成，韬钤夙裕；兼能洞悉海外形势，力任克期可奏荡平。遂训练水师、整顿战舰，扬帆冒险直抵澎湖，鏖战力攻，大战贼众，克取要地，立奏肤功。余众溃遁台湾慑服兵威，乞降请命；已经纳土登岸，听候安插。自明朝以来逋诛积寇，始克殄除。滨海远疆，自兹宁谧。此皆该提督矢心报国，大展壮猷，筹划周详，布置允当；建兹伟伐，宜沛殊恩。施琅，着加授靖海将军；封为靖海侯，世袭罔替，以示酬庸。前进剿云南官员曾各加一级，兵丁赏赉一次；顷因该提督所统官兵出海进剿，勤劳堪念，已经照云南例加级赏赉。复思官兵远抵海疆，冒险剿寇，非滇、黔陆路用兵可比；着再各加一级，兵丁赏赉一次，以示特加优渥至意』。
冬十月己亥（初二日），予澎湖阵亡平阳总兵官左都督赠太子太保朱天贵祭葬，谥「忠壮」。
丁未（初十日），九卿、詹事、科道以海寇底定，请加尊号。上曰：『加上尊号，典礼甚大。台湾属海外地方，无甚关系；因从未向化、肆行骚扰，滨海居民讫无宁日，故兴师进剿。即台湾未顺，亦不足为治道之阙。朕观古来史册，盛世无屡赦之事；此时虽颁赦加恩，小民未必均沾实惠。治天下之道，但求平易宜民而已，何用矜张粉饰！且吴三桂剿后，颁赦未久；今又以升平行赦，殊觉太烦！但愿以平治之道图久安长治，不愿烦扰多事。可将此意传谕九卿，科道、詹事知之』。寻大学士奏：『臣等遵旨传谕诸臣；诸臣言台湾虽在海外，乃海贼历年占踞，凭恃其险，侵扰沿海居民；今皇上指授庙略，剿抚兼施，海贼遂尔向化；皇上威德加于海外，自古以来未有能及。臣等非不知皇上以易简之道治天下，不尚粉饰；惟皇上功德实越古昔帝王，非加上尊号无以慰臣民仰戴之愿』。上曰：『海贼，乃癣疥之疾。台湾仅弹丸之地，得之无所加、不得无所损。若上尊号、颁恩诏，即入于矜张粉饰矣。不必行』。
乙丑（二十八日），福建提督施琅奏：『舟山等处伪总兵有兵丁船只在海岛者，俱遣人招抚；令聚集一处，以杜奸宄』。上曰：『施琅所奏招积各岛船只，筹划周详，甚为可嘉！此等见在海岛船只及伪官兵丁，着施琅严加确察，俱行收抚；务尽根株，毋贻患』！
命吏部侍郎杜臻等在闽、粤、江、浙勘沿海边界，招垦荒地，复诸迁民业。
十二月丙辰（十九日），调施维翰为福建总督（由浙江调）。
康熙二十三年甲子（一六八四）春正月丁亥（二十一日），福建提督靖海将军侯施琅奏：请设台湾镇守官弁。上问大学士等曰：『尔等之意若何』？李霨等奏曰：『据提督施琅奏云：台湾有地数千里、人民十万，弃之必为外国所踞；奸宄之徒窜匿其间，亦未可料。臣以为守之便』。上曰：『台湾弃取，所关甚大。镇守之官，三年一易，亦非至当之策。若徙其民人，又恐失所；弃而不守，尤为不可。尔等可会同议政王大臣、九卿、