知府亦告退。全台各官，如系实任者，如台北之藩司顾兆栋，皆请回去。台南安平县谢寿泉亦告退，以旗人忠满署理，并管台南府印（太尊陈仲英公前年任台湾府，功蒙以文字受知。公为修志局提调，功任采访委员，所作施九缎、戴案诸纪略，尝蒙青眼奖许。其甲戌同年蔡香邻山长生辰，其寿文命功代拟，而叙仲英公之名拜撰。公为翰林院学士，眼光如炬，寿文进呈，幸蒙首肯。及公任台湾道，乙未春，功进郡请谒，见公军书旁午，夜分不寝，会宴嘉义、凤山二县主；是夜功叩陪末席，公谈论国事欷歔太息。功尝赋诗一首，请教于公，以志知己之感云尔）。
同日，台南绅民议请刘军门永福为民主，并设议院、粮台。
初，台立民主，以刘为大将军，所铸银印踌躇不奉送，故刘往来文牒，仍用前部敕帮办之衔。及唐逃厦，台南绅士以台既无主，生员李清泉往凤山请刘为民主，择日会各县绅士拜谒，电邀台中同襄盛举。黎府闻之不悦。台中以路途远涉电辞。刘遂住安平，以其三子守打狗，令陈国馨带义勇三营守海口，令吴光中带义勇守下淡水。并请设立议院，以举人许献琛、贡生徐元焯、生员林馨山等为议员。设筹防局，以兵部郎中许南英、分（？）部郎中陈鸣锵为局长，分五段筹防。东段举人林际春，西段职生李清泉，南段职生吴敦迎，北段职生曾兆琦，中段举人林鸿藻，布置周密。时南路土匪蔓延，使许南英带勇平之。但粮饷支绌，以陈鸣锵为粮台，筹措军需。闰五月十五日（西历七月二十六日），苗栗县李烇与吴汤兴互相攻讦。
前黎府准苗栗钱粮收作军饷，吴汤兴所部之勇每人月饷洋银十二元，开销颇巨，叠向县中索取，不给其用，即将粮串自行征收。李烇厌之，备文详府，以吴汤兴徒博虚名，全无实际，所收饷多为中饱，前各军攻打胜仗，皆徐骧之力，而兴冒为己功，详报上宪。另保举苗人富户黄南球甚洽众望，可为诸军统领，请收兴统领关防。吴汤兴亦备文指李烇短处，请派员代换。黎府不能决，令苗绅和解。两造俱禀台南帮办刘。回电云：『俟派吴彭年到地查明情节核办』。
论曰：吴汤兴与李烇攻讦，刘军门派吴彭年到地查明，吴汤兴乏饷以备器械、募壮士，致日军一鼓而下其城，坐视岩邑沦陷。然李烇仓惶携眷由梧栖港以逃，吴汤兴收合余烬，偕老父妻子至彰化，奉黎府之命，与徐骧诸同志偕行，死守八卦山。嗟乎！廉、蔺交欢强敌不敢压境，张、许同心睢阳不能遽破；古人云，师克在和，谅哉！
闰五月二十日（西历七月十一日），台湾府黎景嵩遣苗栗举人谢维岳向张帅之洞乞师。
台中粮饷缺乏，台南亦无接济。苗栗举人谢维岳年少有胆气，黎遣往南洋大臣张香帅告急，乞师请饷械。香帅命道员易顺鼎到台南查军情。
闰五月二十六日（西历七月十七日），台南南澳镇帮办军务刘永福兼掌台湾总镇印。
台湾总镇万国本闻台湾归日本，四处土匪纷起，乘夜挈眷内渡，将印交刘永福。台南绅民公请刘驻台南府城，令其子常驻凤山打狗督军。闰五月二十七日（西历七月十八日），黑旗前敌正统领县丞吴彭年、副统领副将李维义带兵二营抵彰化。
黎府自攻新竹之后，互有胜负，不愿请刘黑旗助饷。鹿绅力请黑旗带兵恢复。黑旗自备粮饷两个月，以后欲就台中支给，绅富不敢答应。时筹防局绅递公禀请刘帅派兵前来。爰遣吴彭年带屯兵营、旱雷营、七星队，以职生吴敦迎为前敌各军粮台。是日到彰，合城之绅民迎接。年纪止三十九岁，胆略不凡，有儒将风。军令严肃，在彰时凡逃勇皆杀之不殉情。面集四邑绅士，筹款募勇（按吴敦迎，字汝祥，台南人。刘帅派吴彭年来彰，因汝祥彰化有租馆，熟悉情形，同率兵抵彰，担任粮台。时绅富多逃亡，汝祥不避艰险，胆力过人。时功带练勇力孤，得相援助，胆气益壮，地方秩序以安）。
六月初四日（西历七月二十五日），署台湾府黎景嵩以副将李维义代杨载云领新楚军，抵中港，进扎头份。
初，黎到任后连遣兵攻新竹。傅德陞扎十八尖山攻南门，炮力可及新竹城内。杨统领楚军攻北门，郑以金攻西门，以及徐骧等苗勇三面环攻。日本大军未至，城内止千余兵。黎府有顾盼自雄之意，尝云新竹攻破，即欲称为民主，有轻视刘之意。至是刘不自将来彰，以贰尹吴彭年为统领，黎轻之。副统领李维义职居副将，官阶甚高，降为之副，心怀不平。黎府擢为新楚军统领，将随带黑旗兵三百余名往攻新竹。
论曰：自新楚军叠报小胜，黎景嵩举趾高，夜郎自大，尝谓刘军门是战将、非大将，不愿求援台南。又欲赖黑旗之威以克敌，故将吴彭年副带李维义诱为新楚军统领，以接杨载云之任，冀旦夕复新竹，即可称台民主焉。岂知台中彰化一隅，止有地税项三万，两月余间饷金告匮；忽头份与苗栗连败，始愿将新楚军交吴彭年。伊时吴告急台南，旬日间添兵数营，又运地雷枪炮，络绎不绝，然已鞭长莫及矣。左氏称莫敖狃于蒲苏之役，举趾高心不固，殆黎府之谓欤？
六月十五日（西历八月五日），黑旗统领吴彭年统兵自彰化拔队往苗栗，图复新竹。