闭城门，大索饷，勒乡绅富民家财，不应立枭之，抵暮而得数万金。俄而固山兵至，芝豹兵溃，走安平（明季遗闻、郑成功传）。芝龙妻至自本邦，在围城中叹曰：「遥在异域，事既至此，今惜一死，何面目复见人耶」？登城楼投河水自杀。清兵吐舌曰：「妇女尚尔，倭人之勇可知也」（长崎夜话草。本书为成功走漳州时事，今从郑成功传系于此）。芝龙保安平，军容烜赫，炮声振波涛。前与清招抚使窃通信，又自恃先彻关兵，于清有功，闽粤总兵可立得，然犹豫未敢迎清师。博洛遣人招之，芝龙曰：「我非不慕清朝，恐以立主为罪耳」。时固山兵逼安平，芝龙怒，博洛麾而退之，贻书于芝龙曰：「吾所以重将军者，以能立唐藩也。人臣事主，苟有可为，必竭其力，力不胜天，则乘时建不世之功，此又一时也。若将军不辅立，吾何重将军哉？两粤未平，今铸印以相待」！芝龙大喜（明纪编年、明季遗闻、郑成功传），召成功计事；成功泣谏曰：「父教子忠，不闻以贰；且北朝何信之有」（郑成功传）？子弟皆劝入海，曰：「鱼不可脱渊」。芝龙不听，遂进降表；过泉州，大夸张投诚勋，求官者就议价。至福州见博洛，博洛阳欢，折矢为誓，遂痛饮三日；夜半忽拔营，挟而北矣（明纪编年、明史纪事本末、郑成功传）。芝龙从者五百人在别营，临去不得见，亦不许私通家信；对面逼令作家书，书无忘清朝大恩。芝龙曰：「龙本愿不足虑，子弟多拥兵，倘有不测，奈何」？博洛曰：「此与尔无与，亦非吾所虑也」（明季遗闻）。博洛召成功，成功不至；芝龙日：「儿不至，清朝其疲于奔命乎」（郑成功传）！芝龙既行，彩、鸿逵率所部入海，张肯堂等往舟山从鲁王，芝豹独奉母居安平。芝龙至京陛见，奉朝请（明季遗闻）。鲁王既航海，是月定西侯张名振护王至舟山，守将王斌卿拒不纳；至厦门，芝龙已降，失所据，乃至南澳（三藩纪事）。
成功虽遇主列爵，未尝豫兵事，意气容貌犹儒生也。既遭国难，谏父不听，且痛母死非命，慷慨激烈，谋起义兵。诣孔庙，焚所著儒服，拜先师，仰天曰：「昔为孺子，今为孤臣。向背去留，各有所用。谨谢儒服，庶先师昭鉴」。高揖而去。所善陈辉、张进、施琅、施显、陈霸、洪旭等愿从者九十余人。乘二巨舰，断缆行，收兵南澳，得数千人，文移称「忠孝伯招讨大将军罪臣国姓」（郑成功传。按粤游纪闻曰：旗号书杀父报国四字，出没海上」；杀字恐有误）。八月，芝龙使人黄征明赍隆武及芝龙书、彩缎仪物诣长崎乞援兵，幕府下其议宗室三藩及执政（华夷变态。宽永小说，「芝龙」作「成功」，误。和汉合运，「八月」作「十月」。按芝龙之发书在未降清之前，然其书不传，故月日不详）。尾张敬公、纪伊南龙公、水户威公皆欲出援兵（宽永小说）；议未决，长崎奉行报云：「福州既败，芝龙降清」，因令长崎奉行谕使者还，反其仪物（华夷变态）。执政谕诸侯，以援兵议罢（执政谕细川光尚书）。
永明王讳由榔，桂王之子，避乱于梧。以福州既失，广西巡抚瞿式耜与两广总督丁魁楚议，十月立王监国，改元永历；以明年为元年，以肇庆府署为行宫（三藩纪事、明季遗闻。「以明年为元年」，据行在阳秋及郑成功传康熙二年癸卯郑经称永历十七年之文；但成功传又曰「成功起隆武元年迄永历十六年凡十七年」者，以隆武即位为明年，故差一年也）。十二月，清兵来攻，王乘舟避西峡（明季遗闻）。
四年丁亥（永明永历元年、鲁监国二年、清顺治四年），二月，永历至桂林，清兵来攻；三月，避武岗（明史稿、明季遗闻）。成功遥闻永历即位改元，奉朔自南澳归；时彩、联兄弟据厦门、浯州，乃泊舶于鼓浪屿，屿与厦门纔隔带水。七月，与彩、联共攻海澄，不克。八月，与鸿逵合攻泉州，败清提督赵国佐，追围城；援至解围，成功回岛，鸿逵舣舟泉港（郑成功传、三藩纪事。按三藩纪事记成功始末条，率与成功传同，故下文省烦而不并引）。汀、邵并乱，闽邮为阻（明季遗闻）。是月，清兵进湘潭、攻武岗，永历纔以身遁（明季遗闻、三朝实录）；播越入粤，次柳州，入象州（明季遗闻）。式耜出师克全州；十一月，永历还桂（明季遗闻、行在阳秋）。郑彩从鲁王；是岁，鲁王命彩及名振等杀斌卿，与肯堂谋，将还舟山（三藩纪事）。
庆安元年戊子（永明永历二年、鲁监国三年、清顺治五年），正月，永历驾在桂。清兵入全州（行在阳秋）。三月，驾幸南宁（明季遗闻、行在阳秋）。成功攻同安，守将弃城遁；成功令叶翼云守同安，转侵泉州（郑成功传）。四月，成功子经生，立为世子（和汉合运），母董氏（郑成功传。明清斗记曰：「经长而容貌雄伟，善弓马击剑」）。经或称锦（尚之信传）、或称锦舍（华夷变态。按「锦」、「经」华音相近，故转讹称之耳，实非别名也。「舍」、「爷」又音相近，「锦舍」盖「经爷」，而又非别称也）。六月，驾幸浔州（行在阳秋）。七月，清帅佟国器等援泉州，鸿逵入潮，成功入岛，留兵守同安；清兵攻陷城，翼云等死矣（郑成功传）。八月，驾幸端州，端即肇庆（行在阳秋）。清主