夹杂以同升；朝论在舆评，毋轻出言以佐斗：国家要以边事为首务，毋自起室内之戈！今日终以君德为大本，毋徒为将顺之节』！
三月，起刘宗周礼都主事、王之寀刑部主事、高攀龙光禄寺丞。
八月，给奉圣夫人客氏地。以陵工成，命叙录魏进忠；御史王心一、马鸣起、吏科给事侯震旸、倪思辉、朱钦相等先后纠之，降调有差。
二年春正月，起吏部郎中赵南星为太常寺卿。
三月，礼科惠世扬疏参辅臣沈漼借募兵之名为护身之术，阴使其党晏日华潜入大内诱刘朝等练兵，再见江彬之事；外戚郑养性厚募死士，有违祖制。不听。御史侯震旸亦以劾漼，调外。六月，刑部尚书王纪奏劾『辅臣沈漼巧能移人主之视听、力足倒天下之是非，交结权党、诛锄臣士；黄台瓜词已赋，同文馆狱将兴』。又曰：『臣指其蔡京，而漼不肯受；试取惠世扬、周朝瑞、魏大中、董羽宸等疏一一读之，则京之为京，隐括于此矣』！上以烦言责之。漼寻予告回藉，纪革职为民。
八月，以杨涟为太常寺少卿。
兵科给事朱童蒙疏劾都御史邹元标、副都御史周从吾建坛讲学、醵金立院之非。标等上疏自理，上优诏答之。工科给事郭与治复劾内有「比拟妖贼」诸语，上责其狂悖，夺俸。于是元标、从吾五疏乞休；元标即移家出城，遂予告驰驿去。翰林修撰文震孟上言勤政讲学之实，留中；庶吉士郑鄤疏促之，俱降调。太仆少卿满朝荐上言：『国事颠倒』，成于陛下者十之一、二，成于当事大臣者十之八、九』。疏入，除籍为民。
十一月，以赵南星为都察院左都御史。
十二月，以顾秉谦、魏广微为大学士，入阁办事。
三年二月，夺御史周宗建俸。南京御史徐世业劾宗建保举熊廷弼，宗建疏辨，词连郭巩，有『结交宫闱、献媚进忠』之语；中旨切责。
冬十月，以杨涟为右佥都御史，协理院事。
四年二月，推南京吏部尚书邹元标，中旨以衰老罢之。
夏四月，吏都尚书赵南星上言：『吏部四司，惟稽勋司一人，余司皆二人；以稽勋事寡也。然今日之稽勋皆储为文选、考功之用，宜就近推补司官，不拘资格，一省不妨二人』。引陆光祖调吏部吕坤、黄克念等同邑同司之例为言，上从之。于是南星调职方司、郎中邹维琏为稽勋，主外察。维琏与原任主事吴羽文皆江西人。羽文遂拘旧事求去，维琏亦不敢履任；刑科傅櫆疏侵之，羽文求去益坚，维琏亦上疏力辞。櫆复疏以佥都御史左光斗、吏科都给事魏大中交通故内监王安、中书汪文言；诏下言于狱，严讯之。光斗上疏自理，大略为：『櫆之意不利于稽勋有邹维琏、铨司有程国祥、吏垣有魏大中，故欲一网去之』；且指其冒东厂理刑傅继教为兄弟，布置窟穴。大中亦上疏辨；得旨：命大中赴任供职。御史袁化中、给事中甄淑相继为光斗辨。大学士叶向高请骸骨，疏曰：『臣十八疏乞归，皇上谓时艰主忧，臣即去何安！顾臣罪戾多矣，即如科臣傅櫆所论汪文言，实臣具题。左光斗、魏大中之善文言，尚属暖昧；而臣之用文言，则事迹甚明。臣取罪之故，当听公论；不敢妄辨，以滋纷纭。耿耿愚忠，窃谓言官之讦奏，衅不可开；驾帖之拏人，渐不可长。惟皇上罪臣一人而稍宽其它，于以释宫府之嫌、消缙绅之祸』。上慰谕留之。已而大中既莅任，复传旨诘责：大中、櫆情事未明，何得赴任？櫆乃上言明旨不宜二三，中旨恐开旁窃、纠近臣以自解。
七月，大学士叶向高予告回藉。向高再入相，政移忠贤；同事者更希意阿旨，向高动即掣肘。杨琏二十四罪疏上，忠贤恨刺骨；御史林汝翥忤珰，群珰围向高第索之。向高知时不可为，发愤决去；疏三十三上，后得请。
左都御史高攀龙纠劾贪污，御史崔呈秀落职回籍。呈秀巡按淮阳，有狼藉声；吏科都给事魏大中发其馈遗，攀龙因考察劾罢之。已而，呈秀以魏珰义子起用。
冬十月朔，有事太庙，辅臣魏广微不至；魏大中纠其无礼，指称惟奢安不拜正朔。广微深衔之，上疏自辨。御史李应升复疏纠之，谓广微不可见乃父于地下；广微见疏恚甚。广微父，魏允贞也；尝为谏官，得罪阁臣去。降吏科都给事魏大中、吏都员外夏嘉遇、御史陈九畴三级，调外。吏部尚书赵南星、左都御史高攀龙乞罢，许之；给事中沈惟炳疏救不允，亦调外。时推山西巡抚，南星以太常卿谢应祥沈静有为，欲以处之，言于员外夏嘉遇。嘉遇述其意于湖南道御史袁化中，化中深然之。及化中途逢大中，告以故：先是，应祥令嘉善，大中知其才守，遂会推焉。陈九畴有私恨，遂言应祥昏耄，大中以门墙私之；互相奏辨。有旨会勘；吏部坐台臣论人失实上，中旨以朋比切责之，降大中等。于是南星、攀龙皆引罪去；大学士韩爌力救，不听，引疾归。已而刑部尚书乔允升、吏部侍郎陈于庭、都御史杨涟、左光斗、太常卿谢应祥、部属张光前、邹维琏、科道袁化中、许誉卿等一时尽黜，部署皆空。户科给事中陶崇道上言：『诸臣各执成见，不无异同；尤望皇上尽入陶镕，化其畛域。而天语频烦，责以朋比；彼此之互异既章，水火之情形立见。虞廷黜陟，不过贤奸