移军攻镇远，墙坏及地；秀奇窟拒之，卒不克。砺复为隧攻海澄，一夕炮作，成功咤曰：『将薄城矣』！以万人持斧俟。砺军将登，有厮养卒首纵斧，万众从之，随斧随堕，濠为之平；则既旦矣，砺军走，隧中药发，死者无艺。砺走漳州，成功擢厮养卒为都督。
六月，永历帝使封朱成功为漳国公。
秋九月，郝尚久求救于朱成功；成功怒其不会兵援广东，不应。周全斌曰：『倡义，当纳降。郝尚久来归，拒之失天下心』。乃使陈六御入揭阳港，至于南澳；尚久卒以郑鸿逵前攻潮州故，不纳其军。尚久俄没，六御攻鸥汀诸寨而还。
是月，大清使封朱成功为靖海将军、海澄公，再使李德之福建谕成功降，且许提福州、漳州、泉州市舶，捍海寇。使金砺还浙江。
顺治十一年（永历八年）春正月，朱成功使戎政司马陈六御、都督陈应璠自平阳攻舟山，克之；进攻崇明，不克。寻入吴淞，夺其战舰；遂入泰兴、靖江、丹徒，次金山，取其炮；又焚金山、瓜洲舟而返。别使李增、苏茂、黄梧趋广东，攻大埔、饶平诸县。
二月，李德至思明，具述芝龙指；必不可，则执鲁王以献。且言『天下已定，徒劳无功』。成功叱曰：『小人敢鼓舌』！德惧，不敢言。佟岱及降臣刘清泰亦与书，略言『天命所在，不待智者而决』。成功托言无屯军地；而遗清泰书，将以权宜取饷于漳、泉。因约三事：割四府地，不受制于抚部，不预征调，不去其发，一切如高丽；且请屯兵于浙，取温、台、宁波之食；亦不允执鲁王。使其将大掠福州、兴化、泉州、漳州；清泰敛军避之，而言其后必致变。
夏四月，李增等攻饶平、大埔，江龙、刘道璋约内应；拒于吴六奇，不克，还。
五月，朱成功杀督饷官黄恺。恺，泉州人；滑稽多智，毒于聚敛。成功杀之，沿海民始苏。
秋八月，叶成格、阿山及郑渡至福建，再招成功降；且封芝龙同安侯、鸿逵奉化伯、芝豹左都督。鸿逵亦受命，惟成功不从；大陈水陆军数十里，设伏警卫而后见，不伯、芝豹左都督。鸿逵亦受命，惟成功不从；大陈水陆军数十里，设伏警卫而后见，不去其发。索诏书，阿山、叶成格不予，遽还入泉州。成功笑之曰：『事可知矣』！与芝龙书，言『不敢通只字，惧为累。使者猝至，四府无增，疑购父之故事。自古豪杰，利不能动、害不能怵。今惟以「去发」为言，岂不称臣而可去发者？大丈夫作事，磊磊落落。自今以往，父听儿言，则儿为孝子；不听，则儿为忠臣』。又曰：『前使至，盛馆之；不信宿侦骑四出，能无疑虑！父全至今，幸也；万一不幸，惟缟素复仇以结忠孝之局』。亦与渡书绝。芝龙更使鸿逵言之；鸿逵曰：『侄居中左，己次白沙，相见希也』。
冬十一月，朱成功使林云璇疏奏永历帝，上诸将功；使林察、王秀奇、苏茂以舟师卫之。因会李定国于广东（详「湖广之乱」）。
芝龙以成功无降意，惧及祸，乃自首；言『成功请地益军食，且不去发；两寄己书，妄诞无忌，臣不敢隐』。众议芝龙罪，尽夺其秩，锢之高墙；窜芝豹宁古塔。议攻成功。
十二月，朱成功自梅溪、自飞鸾白鹭间道取罗源击吴六奇，大破之；遂取揭阳、澄海三县。
汀州人刘国轩，雄伟有智略，以把总司键漳州，心怏甚；屡说其将朴世用附成功。世用即使国轩行，因冯澄世以见；澄世先与语，大悦之，以为义子，使归为间。是月，成功趋漳州至海澄，甲夜勒兵，莫知所指；漏四下，次州城，国轩启门应，张世耀、朴世用等皆降。分攻泉州，旁掠各邑，于是漳州之县十成功尽下之、泉县十降其七，惟仙游、龙游（？）未即下，成功几有闽地之半。以国轩为护卫后镇。
顺治十二年（永历九年）春正月，朱成功在泉州。降将施琅、韩尚亮固守，郝文兴请击之；成功曰：『善战不如善守，徒损士卒』。使甘辉督诸镇攻仙游，降将陈有虞誓守，炮石如雨，不能克；辉怏甚。神器镇洪善曰：『此葫芦城，宜穴地入』。从之。遂拔仙游，军声益振。
成功承制封拜，以潘赓锺兼户、吏官，陈宝钥为礼官，张光启为兵官，程应璠为刑官，冯澄世为工官，理庶事；改中左为思明州，以邓会知州事。设馆曰储贤、储材；又制察言司、宾客司、军器局、制印局。劝学取士，得黄蒂臣等为六官属及监纪、推官。奉前监国鲁王及泸溪、宁靖诸王于金门，有加礼；以遗臣王忠孝、卢若腾、沈佺期、辜朝荐、徐孚远、纪许国为上客，大事必咨之。分其军为七十二镇，戈船之士数十万。凡封拜，辄朝服北面稽首，焚疏于永历帝座；称为恢复之师。
芝龙在北京为佟国器及降臣龚鼎孳所劾，下之狱。
夏四月，朱成功城浯洲。
五月，朱成功视陆师，凡骑兵五万、步卒亦五万；再视舟师，亦五万：戈铤耀日。别以万人为策应。又铁人万，镔甲彪文，战居于阵首，驰斫马足，铳矢不能入。