玉亦开门出，追奔数十里，斩首数千级。是役也，琏以三百骑破成栋众数万，桂林得全。成栋遁昆阳，旋走阳朔。赖熊复建阳；张家玉再攻东莞，复之（详「义旅」）。
夏四月，以张家玉总督岭东军务。
刘承允虽重瞿式耜，遣兵卫之，而恣睢甚。以长沙陷，请罢何腾蛟为户部尚书；不许。张光璧请讨之，亦不许。承允起小校，受腾蛟荐为大将；屯溪之捷，怨张光璧、郝永忠擢将军，己不得与。驰入黎平，执腾蛟妻子以索饷；腾蛟无如何，使章纩慰之，为请伯爵，与联姻。比至全州，加公爵，赐尚方剑，权势逾腾蛟而犹恶之；至是，径请罢腾蛟，诸镇皆怒。永历帝亦愤，使召腾蛟入图之；腾蛟自白牙历全州、道州，朝行在。
五月，李成栋兵陷和平。
刘承允兵哗饷于桂林，瞿式耜竭公私财贿与之，犹不止；夫人邵氏出簪珥以佐，犹不止。与焦琏军斗，击伤琏；式耜劾承允，兵掠而去。孔有德闻之，急以兵陷兴安，突攻桂林；大雨城坏，吏士失色。焦琏入守，矢贯于肘，愤呼拒敌；式耜躬立矢石中，以西洋炮轰击，敌少却。乃大战，自辰至午，不及食；式耜亲持饭哺之，士益奋，以大雨止。明日再战，琏奋长刀砍除，步骑从之，左右冲击；有德大败，收余兵走。琏军逐北，日数十里。有德望虞山草木，皆以为兵，几为追骑所得。其别将出栗木岭者，式耜使马之骥伏江岸，瞷其至，怒马而渡，□矢掉槊，杀数十人，追北二十里乃还。有德以是不敢轻桂林。论功，进式耜少师兼太子太师，封临桂伯；式耜辞，不许。鲁可藻实与式耜共守，以为广西巡抚。焦琏叹曰：『文臣若此，吾侪宜愧死矣』！
是月，李成栋兵陷琼州。
六月，何腾蛟入朝。陛辞，群臣郊饯；刘承允伏甲将攻之，胡一青、赵印选杀其众。承允讳之，腾蛟乃行。
秋七月，张家玉复龙门、博罗、归善七邑，陈子壮败于高明，李皇一攻肇庆（详「义旅」）。焦琏复阳朔、平乐；鲁可藻复贺县、富川，引其兵与琏会约。陈邦傅入浔州，降臣耿献忠遁；琏、可藻乘之，复梧州。怀集县丞徐定国当城陷走山中，不去发；至是，以计复其城，广西全复。
八月，李成栋陷清远，大学士陈子壮死之。李皇一等亦死于肇庆（详「义旅」）。
冬十月，郝永忠走桂林，何腾蛟、瞿式耜力抚之（详「遗乱」）。
土司覃鸣珂恶守道龙文明，攻柳州；陷之，文明遁。鸣珂大掠去。
李成栋攻博罗，张家玉败死于增城（详「义旅」）。
何腾蛟闻湖南急，出屯于黄沙镇，卫桂林；孔有德攻之，连战数四，腾蛟入兴安，使周金汤等备湖南。
严起恒、刘湘客说式耜分屯诸部及焦琏、卢鼎于平乐、义宁、灵川间。琏军最整，诸将钦服；惟郝永忠起盗贼，极恶之，琏不与较。卢鼎少戢，尝大雨衣笠哨敌垒，昼夜栅守；部将恶之，而不敢动。式耜、起恒悉重之，下诏褒美。
是月，耿仲明陷全州，总兵王某、蒋某御之黄沙河，先遁；守道马鸣鸾以城降，总兵王允成、唐文灿亦降。允成之降也，一军恸哭而散；何腾蛟使何有奇援之，不及。仲明入兴安。
冬十一月，孔有德、尚可喜、耿仲明攻全州。何腾蛟方按部于永宁，瞿式耜使迓之；集焦琏、郝永忠誓神前，转饷给之。腾蛟帅胡一青、焦琏、郝永忠出全州，血战三昼夜，尽溃诸垒，杀获万计，大得名马、橐驼、珍异。有德等走湖南，佟养甲兵亦溃，广西始可守。腾蛟督诸军进，连营三百里。惟陈邦傅自梧州以舟师攻肇庆，猝遇李成栋游骑，即惊溃；骑因逐之，抵梧州。邦傅不知所为，急走浔州；且乞降，而不去其发。永历帝亦不知，惟嘉全州功，议进腾蛟兴新侯，亦侯焦琏；印选、一青皆伯爵，周金汤、熊兆佐、马蛟麟挂印有差。
十二月，何腾蛟自全州大举攻湖南，马进忠等皆莫应。瞿式耜叹曰：『勋帅观望，得非朝廷位置无以慰之』。又曰：『既不能挽治时政，又不能辑和诸镇；内外两无所得，奚补哉』！然诸将起盗贼，志俘杀而不乐战；郝永忠更屠水西四十八堡，横死无艺，时不能问（详「义旅」）。
是月晦，永忠忽南走；焦琏不知故，退兵平乐。诸镇哄溃，腾蛟不及制（详「遗乱」）。
顺治五年（永历二年）春正月，命大理评事朱宿坦谕广西左、右江土司勤王，皆听命。再命何腾蛟出全州、焦琏出平乐，谋进取。
是月，郝永忠入兴安。
二月，郝永忠入桂林，劫永历帝；大杀掠（详「奔亡」及「遗乱」）。瞿式耜至，裸坐；仆假何腾蛟令矢至，乃得出。
孔有德再攻广西，赵印选大惧，弃灵川，走桂林。是日加午至，焚掠益杂，烟焰踰橹楼。焦琏使告瞿式耜，愿以兵屯桂林；曰：『强敌外逼、奸宄内讧，势不能全。然贼乏食，必出掠；因四击之，不过数日，贼可尽矣。然后保全、梧为门户，协力守之，可以无虑』。式耜虑伤民，且惧