成、合吉），合流入海。
湾中港，在仁寿、半屏二里交界（北仁寿、南半屏），县西北二十五里，源受复劲溪，西行五里许，下注万丹仔港。
万丹仔港，在仁寿、半屏、兴隆三里交界（北仁寿、东半屏、南兴隆），县西北十八里，源受五里林溪、湾中港，兼纳十七堰（新顶、草桥、洽心、中心、湾中港，以上五口属仁寿里。公堰、新堰、加埕港、仔墘、合成、挖仔、面前、顶堰、蚝壳、亨宝成，以上十口属半屏里。大道公、顺德，以上二口属兴隆里），合流入海（民渡）。
船仔头港（有桥），在兴隆里，县西北十一里，源受八卦寮陂泉，西南行，兼纳八圳（后港、菜公下、葫芦尾、北圳、中圳、店仔、尾厝、林边）、三陂（七番、檨仔林、客仔陂），下授四尾港，长六里许。
田尾港（有桥），在赤山、兴隆二里交界（东赤山、西兴隆），县西北十里，源受船仔头港，西南行，兼纳一沟（乌鱼）、两圳（赤山下、田尾二）、两陂（新陂、小关帝陂），下授龙水港，长二里许。
龙水港（即硫磺港，民渡），在大竹、兴隆二里交界（东南大竹、西北兴隆），县西北十三里，源受田尾港，西南行，兼纳硫磺陂水尾合流，下授盐埕港，长四里许（按此港亦纳施仁陂水尾，应补入）。
盐埕港（民渡），亦在大竹、兴隆交界，县西十二里，源受龙水港，南行兼纳■〈鱼逮〉港圳三十六陂、岩仔堰二流，下注丹凤澳。
三块厝港（民渡，有桥），在大竹里，县西十里，源受■〈鱼逮〉鱼潭，兼纳五堰（后金顶、后金下、林投围、前金东、前金西），西南行，注丹凤澳。
前金港（民渡），在大竹里，县西十里，源受雨水，西南行兼纳三堰（前金中、前金南、能雅寮后），下注丹凤澳。
前镇港（民渡），在大竹、凤山二里交界（西北大竹、东南凤山），县南十里，源受妈祖港陂，西南行，兼纳南畔圳、庙前陂二流，下注丹凤澳。
竹仔港（民港，有桥），在凤山里，县南十一里，源受六番仔头陂，西南行，汇草衙圳合流，下注丹凤澳。
凤山港（即咸水港，有桥，民渡），在凤山里，县南十七里，源受大桥头陂，合东圳、大草厝陂二流，西行注丹凤澳。
西港（一名旗后港，一名打鼓港），在大竹里，县西南十六里，源受丹凤澳，西行，由港门（旗后、打鼓二山，左右对峙，相距七、八丈，若巨灵擘画然，故曰。港门当中有鸡心礁及港外各暗礁，皆舟行所宜谨慎者也），通外海（浪平可泊轮船）出入（按此港潮之涨退，不过八尺，为他邑所无），内为通商口岸，华洋杂处，商贾云集，经筑炮台，置戍守，洵台南之门户也。
中港（一名中芸港，一名汕尾港），在小竹里，县东南二十五里，源受中厝溪，南行兼纳下廍窟合流入海，两岸相距里许，深丈余，商船便于出入。
东港（民渡），在港东里，县东南三十里，源受东西溪，兼汇后寮、五房洲等流入海，两岸相距三里许，深丈余，内地商船往来贸易，为舟艘辐辏之区。
南平港（民渡，旧志作茄藤港），在港东里，县东南三十三里，源受后寮溪，南行兼纳西港、乌树、大潭、仑仔顶堰入海。
新打港（民渡），在港东里，县东南四十五里，源受姜园溪，西南行兼纳放索等堰合流入海。
丹凤澳（一名朱雀池，俗呼内海仔），在大竹里西港内，县南十里，源受六港（盐埕、三块厝、前金、前镇、竹仔、凤山）、十四堰（红毛港、港口、汫水、新堰、顺兴、德成、裕昌、鲎穴、堰寮仔、中寮、大林尾顶、大林尾下、过田仔、山脚），西行，由港门入海，周三十里，渡船九处（盐埕、三块厝、前金、能雅寮、前镇、竹仔港、凤山港、旗后、哨船头），帆楫往来，款乃声不绝于耳，为县治八景之一（八景中有丹渡晴帆，即此）。近港水深三、四丈，可泊夹板洋船。
白沙尾澳，在小琉球屿北，县东南六十里（可泊小艇，其上水师汛在焉）。
花瓶仔澳，在小琉球屿西北，县东南六十二里（有花瓶石，肖形而名）。
杉板路澳，在小琉球屿西，县东南六十五里（旧时有杉板船泊此，故名）。
大寮澳，在小琉球屿东，县东南六十六里（地近尖山，有泉两穴可资灌溉）。
天台澳，在小琉球屿东南，县东南七十里（下有巉石暗礁，舟误犯之立碎）。
右全邑港澳，凡二十八条。其中可通大船往来暂泊者，惟东、西、中三港；可容久泊者，仅丹凤一澳耳。余则各从其类，附记备釆而已（以上诸川，以下水利）。
圳道（水利一）
旧寮圳，在港西里，县东北五十一里，源由尖山溪上游引水，西南行十二里，至蒲姜仑下注二重溪，灌田一百六十甲。
狮仔头圳（一名涂库圳），在港西里，县东北五十