收听言之效，喜怒轻发，号令屡更，见群臣庸下而过于督责，因博览书史而务求明备。凡上所长者，皆臣所甚忧也。其言曲中聿键之短云。
都察院张肯堂请出募舟师，由海道抵江南倡义旅，而劝聿键驾由仙霞趋浙东，与相声援。聿键乃加肯堂少保，给敕印便宜从事。擢文选郎中朱永佑为吏部右侍郎、福州推官徐孚远为兵科给事中从行，二人皆肯堂里人也。芝龙阴阻之，不成行。
是月曾妃至，册为皇后，赠妃父文彦为吉水伯。妃警敏通文章，聿键手批奏章多至数百言，不及者必送妃代批。每群臣奏事，妃于屏后侧听，俟聿键退朝，共决可否。聿键颇严惮焉。
九月，流贼李自成窜死，湖广总督何腾蛟收降其将刘体仁等所部十余万。而自成兄子锦奉自成妻高氏，拥众三十万，复至丰州乞降于湖南巡抚堵允锡。表至，聿键大悦，加允锡兵部右侍郎兼右佥都御史，总制其军，手书奖劳。锦等皆赐名授官，号其营曰「忠贞」，置之荆州。拜腾蚊东阁大学士兼兵部尚书，封定兴伯，仍督师，令规取江西。
先是鲁王以海在台州，兵部尚书张国维与给事中熊汝霖等奉以海监国于绍兴。十月，聿键使给事中福安人刘中藻颁诏浙东，国维驰疏上聿键，略言国当大变，凡为高皇帝子孙，所宜同心并力，共图兴复，成功之后，入关者王。且监国当人心涣散之日，鸠集为劳，一旦南拜正朔，鞭长不及，悔何可追。臣老矣，岂敢朝秦暮楚，有所左右于其间哉？聿键乃召中藻还，自是闽、浙如水火矣。
是时，我大清兵入江西，诸郡皆平，惟赣州未下。左庶子杨廷麟、修撰刘同升与南赣巡抚李永茂集士大夫于明伦堂，劝输兵饷，协谋举事，立忠诚社，招致几三万人。聿键手书至赣，加廷麟兵部尚书、同升国子祭酒。既而廷麟、同升复吉安、临江二县，命廷麟以本官兼东阁大学士、赐剑便宜从事，复擢万元吉为兵部右侍郎，总督江西、湖广诸军并兼南赣巡抚。廷麟等请聿键出江右，何腾蛟请出湖南，浙中诸将请出衢州，苏观生以闽中事权悉为郑氏所握，极言廷麟、元吉可倚，劝聿键幸赣州。于是聿键决意自赣入楚，遣观生先行，赴赣州募兵。芝龙知物论不平，非出关无以弭众议，乃请以郑鸿逵为左先锋出浙江，郑彩为右先锋出江西。聿键令筑坛，设天帝、高皇神位，驾幸西郊行授钺礼。甫拜跪，风雨晦冥，大风起，坛上烛皆灭。及鸿逵出城，马蹶踣地，识者以为不祥。鸿逵至仙霞镇，托候饷，驻不行。十一月，聿键下诏，以唐王聿钊、邓王鼎■〈土器〉监国，大学士曾樱协同郑芝龙留守，以吴震文为随行兵部侍郎、王观光为随行户部侍郎，皆兼吏、兵、礼三部，张家玉、王履贞为随行兵科，亦兼吏、户、礼三科。十二月，聿键戎服登舟，大学士何吾驺等从。大学士黄道周进至婺源，遇我大清兵，战败被执，诸军皆溃。聿键驻跸建宁县。我大清顺治三年正月己酉朔，聿键不受朝贺，以三大罪自责。鲁王以海自见兵力孱弱，遣柯夏卿、曹惟才聘于聿键。聿键手书报以海曰：朕无子，王为皇太侄，同心戮力，共拜孝陵。朕有天下，终致于王。浙东所用职官，尽列朝籍，无彼此。二月，聿键将出汀州。芝龙不欲聿键入赣，令军民数万人遮道呼号，拥聿键，不能行。芝龙具表请回天兴。聿键不得已，退驻延平。三月辛未，我大清兵克吉安。时郑彩屯广信府，弃城奔入分水关。聿键削彩职，令图功自赎。四月，聿键命礼臣追复建文年号，立忠臣方孝孺祠。五月，廷试贡生，取万荆等十二人，命为萃士，照庶吉士例翰林院教习。六月，福京乡试，广额七十名，流寓者皆入试。以编修刘以修、闵肃为主考，取叶瓒等一百七十五名。士子多以贿进，乃命覆试，落四名，逮同考推官王三俊下狱，追赃一万两。
浙东师溃，鲁王以海航海走入南澳，闽中大震。芝龙假言海寇入犯，宜往备御，拜疏即行，尽撤福京兵回安平镇。鸿逵在关外，亦退驻浦城，仙霞岭二百里间无一人守者。七月，元子生，大赦，加恩从龙诸臣。钱邦■〈卺，艹代丞〉言：浙东新破，唇亡齿寒，举朝卧薪尝胆之日，非覃恩受赏时也。不报。己巳，聿键御门内侍奉一箧置前，聿键谕群臣曰：朕本无利天下心，以诸卿拥戴，勉徇群情。越在海隅，布衣蔬食，何有人君之乐？正是上为祖宗，下为百姓，朝夕干惕，惟恐负卿等立君之意。岂料诸卿已变初心？昨关上主事搜得闽中出关迎降书二百余封，今具在此。朕不欲知其姓名，令锦衣卫官对众焚之。卿等宜无负初心也！聿键长身丰颐，声如洪钟，闻者悚息。
八月，我大清兵至仙霞关，长驱而入。巡抚上游四府兼领关务郑为虹亟还浦城，纵士民出走，自守空城。无何，城破，为虹与给事中黄大鹏并死之。为虹，江都人。大鹏，建阳人。巡抚杨廷清、李瑄亦俱被执，死之。我大清兵遂下建宁府，时何腾蛟遣郝永忠迎聿键，尚未入闽，聿键得仙霞关败问，自延平仓皇出走，留兵部侍郎曹履泰偕延平知府王士和居守，惟忠诚伯周之藩与给事中熊纬率兵五百余随行。警报迭至，士和召父老曰：吾虽一月郡守，当与城存亡，若等可速出，毋使数万生灵尽膏斧锧。