曹履泰、海澄知县刘斯■〈土来〉合兵击败之。
芝龙为履泰、斯■〈土来〉所败，由厦门抵铜山。旬余，攻杜浔堡。乡宦邱懋炜率众拒却之。芝龙遂入广东。时漳州人颜继祖为工科给事中，上疏曰：『郑芝龙生长泉州，凡我内地之虚实，靡不了然胸中。加以岁月所招徕，金钱所诱饵，聚艘数百，招徒数万，城社之鼠狐，甘为牙爪，郡县之刀笔，尽属腹心。乡绅偶有条陈，事未行而机先泄；官府纔以告示，甲造谤而乙讹言。复以小惠济其大奸，礼贤而下士，劫富而资贫。一人作贼，一家自喜无恙，一姓从贼，一方可保无虞；惟酝酿以有今日，则大将俞咨皋无所逃罪矣。夫抚寇者，必未抚之先晓以利害，示以恩威，使之摇尾乞怜；又必既抚之后，散以原籍，领以的保，使之谋生乐业。而咨皋招之海，仍置之海，首从从无分别，商民任其劫掠。且也，杀人可以不死。家享巨室良田之福，而身被红盖。腰金之贵人皆有所利而为贼，何所惩而不为贼乎？荏苒居诸，于今八月，不闻咨皋有尺寸之树。岂谓贼稍离汛地，遂可矫语驱除之功乎？贼避北风，非慑咨皋。阅其辅车唇齿之势，粤危则闽不得独安。贼若再顺风为阵，臣有以知咨皋之束手无措也』。疏入，廷臣会议，咨皋即解任逮下狱。
二月，武平贼苏阿婆等攻县城弗克，转攻武平所；署守备千户徐必登等死之。
必登莅任甫两日，闻县有急，与镇抚陈应龙、哨官徐治、陶志学、殷元望、丁显统所军赴援。所军不前，必登麾亲军及家僮策马至麻姑墩遇贼，亲军窜走，必登遇害。家僮抱尸而哭，贼磔之。应龙等皆死乱贼中。
夏四月，兵备道董象恒率上杭知县吴南灏讨武平贼，大败之。
把总韩应琦等进剿，杀贼酋龚二。贼纵火攻温家楼。适象恒与南灏兵至，大败贼于桐盘岭。五月，象恒督兵直抵贼巢。贼众冲击南灏营。应琦与把总张承祚出拒战。南灏麾甘莲都司率兵助之。贼败奔蛇径，自相践踏，死者不可胜数。
五月，海贼周三老犯悬锺所。
六月，武平百户曹经等击贼于东流坑，死之。
贼将出寇江西会昌县，经与贼遇于东流坑，战败，被贼搤杀。哨官罗应时、马万宗、把总朱球及兵卒死者数十人。
降贼杨禄、杨策复叛。
禄、策遁至乌洋，招集百余艘，散劫悬锺所、卸石湾等处。焚兵船民舍，杀僇不计。
秋七月，武平贼攻县城，知县巢之梁会上杭知县吴南灏击败之。
九月，海寇郑芝龙复降，诏授防海游击。
卢毓英言于泉州知府王猷，盛称芝龙材武，假以一命，当可再招。猷首肯之。及巡抚熊文灿至，猷条陈时事，并言芝龙两胜洪先春不追，获卢毓英不杀，俞咨皋败至海门中左弃城遁，芝龙约束其众不许登岸，实有归顺之萌；今剿难卒灭，不若遣人往谕，许其以立功赎罪。文灿乃遣毓英招芝龙。芝龙至，愿以剿平诸盗自任。
文灿大喜，奏题防海游击。然芝龙踞海滨近海州县，皆勒民报水如故。
冬十月，武平贼攻象洞，守备李铎死之。
上杭知县吴南灏督兵至象洞，而铎兵已先到。贼从小路冲击，官兵惊溃，拥南灏归。铎步战，杀数人而死。哨官周以弼、洪万余、日者马逸山皆遇害。
十一月，武平贼围上杭县，知县吴南灏督乡兵拒战，破之。
贼自佛子皋来屯校场前。三涂百姓尽忿，愿杀贼。赖思养招兵千人，赖君迁、邱汝华、李朝育、温子皋各招数百人，求战。南灏许之。乡兵直攻贼营，杀贼数百人，复遁归洞。
十二月，巡海道曾樱率兵讨武平县九莲山诸贼，悉平之。
樱募壮士，夜捣贼巢。凡岩前、象洞、米坑、箬策诸乡，少长悉戮无遗。苏阿婆率众五百人遁入广东平远县，县令诱而歼之。
二年夏，降寇李魁奇复叛，攻陷金门后浦。
魁奇，惠安人。少时沿海捕鱼，识水性，能沈水底半日不起。及壮，纠诸鱼船往来海上为盗，与郑芝龙俱受抚。至是再叛。
六月，李魁奇寇海澄县；知县余应桂遣兵击败之。
游击郑芝龙斩杨禄、杨策于金门港，收其众。
秋八月，李魁奇寇龙溪县；把总吴兆燫、张天威等击败之。
魁奇寇龙溪、福浒、石码。兆燫与哨官蔡春获其战舰一艘。哨官贾希战死。义勇张字移炮碎贼舰于海澄港，贼大溃。天威手擒渠魁黄杰。总兵赵震饱贼赀，出杰于狱，贼复炽。炮营守备鲁大廷、把总袁德击之。德被伤，冲锋许界、壮士张明俱战死。天威挥戈奋击，吼声如雷。兆燫与其弟兆炜、翼袁德裹创大战，所向披靡。贼遁出港。腰城及炮营诸军发炮击碎贼艘无数。是役也，死伤相半，然贼自是不振。
郑芝龙击败李魁奇于料罗，斩之。
陈衷纪等自台湾渡海，欲与芝龙相见。船至澎湖，为魁奇所掩，衷纪与杨