子敬走入德化。
夏四月，官军剿海澄小东山贼，克之。
秋九月，郑成功自江南逃回厦门。
成功犯江南，大败，精锐丧尽，乃勒沿海居民为寇。
是年，广东饶平总兵吴六奇率师剿诏安贼江警庸等，平之。
警庸等啸聚诏安，密结郑成功入寇，将为内应。知县欧阳明宪知其谋。适六奇奉调至漳，明宪以告六奇，遂讨平之。寻剿乌山贼巢，擒其首蔡四。
宁洋民吴元英等作乱，知县萧亮剿平之。
十七年夏四月，建宁县把总刘得动作乱，杀知县温光涵。
五月，将军达素、总督李率泰、提督马得功、海澄公黄梧会兵进剿厦门，不克。
素等分满汉官军大船出漳州港，小船出同安港，檄广东饶平总兵吴六奇及投诚总兵碣石苏利、南洋许龙等同会岛上。成功以伪将王秀奇等守高崎，遏同安兵，伪左镇黄安等出梧州，遏广东兵，自勒诸部扼海门，令伪五府陈尧荚传令诸将碇海中流，按军不动。甲子旦，官军乘风利直逼海门，阵斩伪闽安侯周瑞及尧荚。成功望见官军云至，顾问左右：『流平否』？对言『已平』。成功曰：『流平则潮转，潮转则风随，发炮俾诸将起碇迎敌』。贼巨舰争先横击，风吼涛立，官军船多触坏，眩晕不能战，遂大溃。先是伪右武卫陈鹏密送款，约官军渡五通江袭厦门。率泰令总兵施琅驾船应之。先锋官军恃有约，未至岸争先下。鹏所部陈蟒不与谋，见官军参至，大骇曰：『此急矣！当决一死战』。麾其属进击。官军退陷淤淖死者十之七八。苏利等舟至南澳，闻闽兵失利而还。
秋七月，海寇犯莆田县黄石等乡，三日乃去。
秋十月，宁化贼曾长等伏诛。
十一月，兴泉道胡升猷偕提督马得功督兵捕龙岩贼季月高、德化县许子敬，斩之，余党悉伏诛。
靖南王耿继茂由广东移镇福建，都统宗室罗托为安南将军督剿郑成功。
十八年春二月，兴泉道胡升猷遣兵剿泉南贼柯瑞等，平之。
夏四月，郑成功攻台湾赤嵌城，据之。
台湾久为和兰所据，筑二城：其渠揆一王所居曰王城，而酋长长猫难实丁守赤嵌。成功自江南败后，每以厦门地狭为忧。适和兰甲螺何斌以侵用揆一王库银惧，潜渡厦门见成功，言台湾可取状。诸伪将皆以险远，议不决。成功锐意从斌言，留洪旭等佐子锦守厦门，捩舵束甲遂行。三月，泊澎溯。徇曰：『■〈目氐〉吾鹢首所向』。先是，和兰沈坏夹板桥于鹿耳门以防外艘。比成功至，水骤涨丈余，大小战舰衔尾而进。成功引兵登岸攻赤嵌城，克之，而揆一王犹死守王城。成功乃筑籧篨，环七鲲身以逼之。
六月，郑成功伪将蔡禄、郭义以铜山降；寻复为伪将黄廷等所陷。禄、义密送款于海澄公黄梧，以铜山降。已而成功遣黄廷、陈霸至，而禄、义已入八尺门矣。乃以伪将洪天佑、黄元相守之。
秋八月，郑成功攻台湾和兰王城不克，和兰寻引去。
和兰揆一王尽出其众，水攻赤嵌，陆攻鲲身。成功令黄安等御之。和兰大败，仍退守王城。成功使人告之曰：『此地我先人故物，珍宝厅尔载归，地仍归我』。和兰度力不敌，引去。成功乃以赤嵌城为承天府，设天兴、万年二县，改和兰王城为安平镇；凡诸土番皆受约束。
徙沿海居民于内地。
筑垣为界，拨兵戍守，有私出界者斩，寸板不许下水，以绝接济。然守界兵颇横恣，得贿仍从出入。有睚眦怨者，辄推出界墙外杀之，官不能问也。郑成功闻令下，叹曰：『使吾徇诸将意，不自断东征，不得块土，英雄无用武之地矣』！海澄公黄梧毁郑成功祖坟。
梧上言：『叛臣贼子诛及九族，况其祖乎？成功祖墓现在各处，宜一概毁掘，断其命脉，则种类不待诛而自绝』。乃悉发郑氏诸坟。明年，成功死，人皆以梧言为有征。
冬十月，郑芝龙及子世恩、世荫、世默等皆伏诛。
先是，十二年正月，左都御史龚鼎孳疏劾芝龙蒙荣养者十年，而成功桀骜自若，家仆往来岛上，书信频通，子弄兵海壖，父高枕都下，酿祸之根，请早除之。而巡抚佟国器亦获芝龙与成功私书，上之。诏革芝龙爵，下狱。其冬十二月，芝龙仆尹大器首其父子交通状。敕芝龙自狱中以手书招成功，不降即夷其族。成功置若罔闻。十四年三月，海澄公黄梧具揭兵部，请速翦芝龙以绝盗根。诏流芝龙及其家属于宁古塔。梧等谓不杀芝龙，成功之心不死，海上诸伪将投诚之意不决。总督李率泰以闻，且言芝龙不宜流徙宁古塔，恐其地近海，由此而遁，为患滋大。得旨嘉纳。及是，芝龙及子孙十一人皆伏诛。
宁洋贼黄盛车、郑惟荣、李玉瑞作乱，知县萧亮剿平之。
康熙元年春正月，海寇犯定海小埕，总督李率泰会靖南王耿继茂遣兵击走之。
三月，南澳伪忠勇侯陈豹降。<