陈璸重修。五十六年，里人鸠众就原址重建。乾隆三年，台湾道尹士俍重修（明宁靖王书匾额曰「古今一人」）。雍正五年奉旨：春、秋祀以太牢；仍追封三代（祠在后殿）。雍正三年，台湾道吴昌祚拨凤山县大港社田租粟六十石以供香灯。乾隆十七年，台湾道金溶重建。三十年，知府蒋允焄重修，改庙左高公祠为官厅一座。又一在西定坊港口、一在土墼埕（今圯）、一在安平镇、一在道署内、一在许厝甲、一在保舍甲、一在长兴里、一在新丰里、一在保大东里。
天后庙：一在西定坊，即宁靖王故居；康熙二十三年，靖海将军施琅改建为庙（有碑记）。雍正四年，御赐匾曰「神昭海表」。乾隆二年，敕封「护国庇民、妙灵昭应、弘仁普济、福佑群生天后庙」。有香灯园二十一甲，在安定里，年得租粟一百二十五石；诸邑令季麟光置，交庙僧掌收。乾隆三十年，知府蒋允焄重修，庙前另置官厅一座。一在水港尾、一在西郭外海边砻米街、一在船厂、一在砖仔桥、一在鹿耳门、一在安平镇渡口。
龙王庙：在宁南坊。康熙五十五年，台厦道梁文科建。乾隆四年，知府刘良璧修。三十年，知府蒋允焄重修，庙左另建官厅一座。
田祖庙：一在镇北坊。康熙五十五年，台厦道梁文科建（有记）。一在广储西里、一在保大东里。
仓神庙：在镇北坊赤嵌楼后，雍正十年，知县林兴泗建。乾隆十五年，知县鲁鼎梅修。
文昌阁：在朱文公祠后。台厦道陈璸建。高出祠宇，窗棂四辟。乾隆五年，提学杨二酉再塑像于小南门楼。
魁星堂：在道署左侧。台厦道吴昌祚建。乾隆五年，提学杨二酉再塑像于大南门楼。
风神庙：在西关外接官亭后。乾隆四年，巡道鄂善倡建。乾隆三十年，知府蒋允焄重修。
火神庙：在小南门外法华寺内。康熙四十七年，凤山知县宋永清建。乾隆三十年，知府蒋允焄重建（碑记载「艺文」）。
台湾县
文庙：在东安坊（有碑记，载「艺文」。规制详「学校」）。
崇圣祠：在大成殿后。
名宦祠：在学宫内。
乡贤祠：在学宫内。
城隍庙：在镇北坊。知县张宏建。乾隆十六年，知县鲁鼎梅重修。又安平镇城隍庙：乾隆十四年，水师副总兵官沈廷耀建。
忠义孝悌祠：在学宫内左侧。雍正元年，奉旨建。祀总兵官欧阳凯、副将许云、游击孙文元、游崇功、守备胡忠义、千总蒋子龙、林文煌、赵奇奉、把总林彦、李茂吉、石琳、千总林文煌之弟林文甲；俱康熙六十年台变殉难。有司春、秋致祭。
烈女节妇祠：在镇北坊。雍正元年，奉旨建。乾隆十六年，邑廪生侯世辉重修。祀烈女纪氏险娘、节妇余氏预娘、节妇袁氏、孝行张氏、节妇赵氏、节妇郭氏，孝行林氏、节妇陈氏、烈女黄器娘；俱奉旨旌表，有司春、秋致祭。另有贞节坊二座：一在禾寮港街；伪时为谢灿妻郑宜娘建。一在十字街；康熙六十年，为陈越琪妻黄器娘建。
凤山县
社稷坛：在兴隆庄县治北门。
风云、雷雨、山川坛：在县治北门。
先农坛：在县治东门外。
邑厉坛：在兴隆庄（列「祀典」）。又一在淡水港东。伪时安置罪人所，鬼频为厉；康熙五十八年，知县李丕煜令淡水司巡检王国兴建祠祀之，以后不复为厉。岁时，俱乡人祀。
文庙：在兴隆庄北门外。
崇圣祠：在大成殿后。康熙四十三年，知县宋永清建。
名宦祠：在学宫。
乡贤祠（未建）。
城隍庙：在县治北门外。
关帝庙：在县治东门内。雍正五年，知县萧震建。乾隆二十八年，知县王瑛曾重建。一在半屏山大湾、一在大竹桥。
天后庙：一在县治北门内龟山之顶。一在兴隆庄左营；康熙二十二年奉旨建。乾隆二十七年，知县王瑛曾重建。
八蜡祠：在兴隆庄龟山之阴。康熙四十五年蝗灾，知县宋永清忧之，建祠祷祝。
忠义孝悌祠：在学宫左。雍正元年，奉旨建。祀守备马定国、千总陈元、把总林富、领旗王奇生；俱康熙六十年殉难。有司春、秋致祭。
烈女节妇祠：在县治北门。祀阮氏荫娘、郑氏月娘、黄氏叶娘。康熙四十八年，知县宋永清建坊；雍正元年，奉旨建祠。春、秋致祭。
诸罗县
社稷坛：在县治东南隅。
风云、雷雨、山川坛：在县治东南隅。
先农坛：在县治东南隅。
邑厉坛：在县治北隅。
文庙：在县治西隅（有碑记，载「艺文志」）。
崇圣祠：在大成殿后。
名宦祠、乡贤祠（俱未建