『诣读祝位』。献官至香案前。引赞唱：『跪』。通赞唱：『众官皆跪』；唱：『读祝文』。读祝者取祝版跪读。祝曰：『维乾隆某年，岁次某干支，二（八）月某干支朔，越某日某干支。正献官某、分献官某敢昭告于至圣先师孔子之神曰：维师道冠古今，德配天地；删述六经，垂宪万世。今兹仲春（秋），谨以牲帛、醴粢，祗奉旧章，式陈明荐；以复圣颜子、宗圣曾子、述圣子思子、亚圣孟子配。尚飨』。读毕，麾生举麾，乐续作（初读祝时，麾生偃麾，乐暂止；至是，接奏未终之曲），读祝者将祝版复置神案上。通赞唱：『叩首……（献官行三叩礼）；兴，平身』。引赞唱：『诣复圣颜子神位前』。赞：『跪』；赞：『奠帛』；赞：『献爵』（俱如正祀仪）。引赞唱：『叩首；兴，平身』。赞：『诣宗圣曾子神位前』。赞：『跪』（如前仪）。引赞赞：『诣述圣子思子神位前』。赞：『跪』（如前仪）。通赞唱：『行分献礼』。另引赞各引分献官，十二哲、两庑俱如正祀仪。引赞赞：『诣亚圣孟子神位前』。赞：『跪』（如前仪）。引赞赞：『复位』。麾生偃麾，擽敔止乐。引赞引献官及分献官由西角门出，复于原位朝上立。通赞唱：『行亚献礼』（俱如前仪，惟不盥洗、不奠帛、不读祝文）。麾生举麾，唱：『乐奏和平之章』。击柷作乐，舞生按节而舞。献毕，唱：『复位』。麾生偃麾（如前仪）。通赞唱：『饮福、受胙』。引赞赞：『跪；饮福酒』。东执事进爵，献官饮讫，西执事接置神案上。引赞赞：『受胙』。东执事进胙，献官受讫，西执事接胙由中门出。引赞赞：『叩首；兴，平身，复位』。通赞唱：『跪；叩首……（正献、分献、陪祭各官俱行三跪九叩礼）；兴，平身』。通赞唱：『彻馔』。麾生举麾，唱：『乐奏咸平之章』。乐作、舞止。『彻讫』。将神案上品物略移动。通赞唱：『送神』。麾生举麾，唱：『乐奏咸平之章』。乐作、舞止。引赞赞：『跪；叩首……（正献、分献、陪祭各官俱行三跪九叩礼）；兴，平身』。麾生偃麾（如前仪）。通赞唱：『读祝者捧祝、司帛者捧帛，各诣瘗所』。正祝由中门、左右配哲由左右门、两庑各随班，俱诣瘗所。通赞唱：『诣望瘗位』。各献官诣瘗位。麾生举麾，唱：『乐奏咸平之章』。有乐、无舞（乐章同送神）。通赞唱：『望瘗』；唱：『焚祝、帛』；唱：『复位』。麾生偃麾，乐止。通赞、引赞同唱：『礼毕』。各官俱退。
文庙祭毕，乃祭朱文公祠，帛一、羊一、豕一、簠一、簋一、笾四、豆四。次祭名宦祠、次祭乡贤祠，品物俱同（台「乡贤」尚缺）。朱文公祠主祭官，台湾府知府或委员。其盥、瘗、奠献，俱如仪；迎神、送神，俱一跪三叩（乾隆十年议准：每逢朔望，直省文武大员于文庙行香后，即亲诣崇圣祠行礼。或有事，则委教官代）。
文庙神主位次：正殿：至圣先师孔子神位，正中南向。四配：复圣颜子、述圣子思子，在殿内东傍，西向；宗圣曾子、亚圣孟子，在殿内西傍，东向。十二哲：先贤闵子（名损）、先贤冉子（名雍）、先贤端木子（名赐）、先贤仲子（名由）、先贤卜子（名商）、先贤有子（名若。乾隆三年，自东庑升），在殿内次东，西向；先贤冉子（名耕）、先贤宰子（名予）、先贤冉子（名求）、先贤言子（名偃）、先贤颛孙子（名师）、先贤朱子（名熹。康熙五十一年，自西庑升），在殿内次西，东向。东庑：先贤蘧瑗、先贤澹台灭明、先贤、先贤南宫适、先贤商瞿、先贤漆雕开、先贤司马耕、先贤梁鳣、先贤冉孺、先贤伯虔、先贤冉季、先贤漆雕徒父、先贤漆雕哆、先贤公西赤、先贤任不齐、先贤公良孺、先贤公肩定、先贤邬单、先贤罕父黑、先贤荣旗、先贤左人郢、先贤郑国、先贤原亢、先贤廉洁、先贤叔仲会、先贤公西舆如、先贤邽巽、先贤陈亢、先贤琴张、先贤步叔乘、先贤秦非、先贤颜哙、先贤颜何、先贤县亶、先贤乐正克、先贤万章、先贤周敦颐、先贤程颢、先贤邵雍、先儒谷梁赤、先儒伏胜、先儒后会、先儒董仲舒、先儒杜子春、先儒范宁、先儒韩愈、先儒范仲淹、先儒胡瑗、先儒杨时、先儒罗从彦、先儒李侗、先儒张栻、先儒黄干、先儒真德秀、先儒何基、先儒赵复、先儒吴澄、先儒许谦、先儒王守仁、先儒薛瑄、先儒罗钦顺、先儒陵陇其（东庑共六十二位）。西庑：先贤林放、先贤宓不齐、先贤公冶长、先贤公晢哀、先贤高柴、先贤樊须、先贤商泽、先贤巫马施、先贤颜辛、先贤曹恤、先贤公孙龙、先贤秦商、先贤颜高、先贤壤驷赤、先贤石作蜀、先贤公夏首、先贤后处、先贤奚容蒧、先贤颜祖、先贤句井疆、先贤秦祖、先贤县成、先贤公祖句兹、先贤燕伋、先贤乐欬、先贤狄黑、先贤孔忠、先贤公西蒧、先贤颜之仆、先贤施之常、先贤申枨、先贤左邱明、先贤秦冉、先贤牧皮、先贤公都子、先贤公孙丑、先贤张载、先贤程颐、先儒公羊高、先儒孔安国、先儒毛苌、先儒高堂生、先儒郑康成、先儒诸葛亮、先儒王通、先儒司马光、先儒欧阳修、先儒胡安国、先儒尹焞、先儒吕祖谦、先儒蔡沈、先儒陆九渊、先儒陈淳、先儒魏了翁、先儒王柏、先儒许衡、先儒金履祥、先儒陈澔、先儒陈献