佥都御史，巡抚其地。南都立，亮疏言：『南北只隔一河，贼若从山东来，则淮、徐据黄河之险，我能守之，若从河南来，则无险可守。今茫无稽察，致垄断者饱载而贩于贼巢；滨河者所司何事而疏玩若此哉？乞饬严加盘诘，贩卖者治以通贼之罪』。又言：『贼势可图，请解职视贼所向，督兵进讨』。而马士英意殊不在贼，诏亮还任。明年四月，左梦庚陷安庆，被执；挟与俱北，乘间赴水死。我朝赐通谥，曰「忠节」。
祁彪佳字幼文，一字宏吉，又号虎子；山阴人。年十七，举于乡。又四年，成天启壬戌（一六二二）进士，授兴化府推官。吏易其年少，操土音侮之。彪佳买二麤婢，密询之；浃旬升厅事，遍召诸吏声其罪，众惊以为神。故事：巡按御史率倚推官为耳目，其胥吏奸恶无问者；彪佳倡议：访犯先从推官左右始。人服其公，政绩大着。遭父丧，去职。
崇祯初，擢福建道御史。进封「事略」云：『凡文武内外大小诸臣，必使之安其位，而后尽其心。迩来六卿九列之长，诘责时闻、引罪日见；因而周章急遽，救过不遑。窃恐当事诸臣怵于严旨，冀以迎合揣摩，善保名位。臣所虑于大臣者，此也。人才中、下参半，藉上感发其忠义、鼓舞以功名。今司道有司，或钦案之累由人、或钱榖之输不足，降级、住俸十居二、三；必至苟且支吾，急功赴名之心不胜其掩罪匿瑕之念。臣所虑于群臣者，此也。陛下闻鼓鼙而思将帅之臣；倘得真英雄，即推毂设坛，夫岂为过。或奖拔之术未尽，则冒滥之窦将萌。臣所虑于武臣者，此也。陛下深惩惰窳，特遣内臣，抚按之事多令监视。正恐同罪、同功，反使互蒙、互蔽：开水火之端，其患显；启交结之渐，其患深。臣所虑于内臣者，此也』。忤旨，切责。军兴，上「合筹天下全局」疏。帝善之，下所司。
出按苏、松，宜兴翰林陈于鼎、陈于泰暴于其乡，民乃聚焚其庐、发其祖墓并及首辅周延儒祖墓，汹汹不散。彪佳单骑往，捕治如法，而于延儒无所徇；延儒憾之。吴中奸民结党立「天主」名号，横行乡里，有司不能制。彪佳廉得其魁四人，召绅士父老会鞫城隍庙，杖杀之；民大称快。表礼郡中清修之士归子慕、朱升宣、张基等，奉羊酒鼓吹骑从到门以见，并疏其学行于朝，请授翰林院待诏；士林以为盛事。既而回道考核，延儒讽主考者镌一级；帝察其无罪，祗令降俸。寻请终养归，从刘宗周游，其学益进。
家居九年，母服阙，召掌河南道事；请留宗周表率百官。又以京察不当，面斥吴昌时于朝。十六年（一六四三），佐大计，绝请谒。寻以刷卷南畿；乞休，不允。便道还家；闻京师陷，恸哭赴南都。福王至，群议援宋高宗故事，立为兵马大元帅；彪佳曰：『今与宋不同，宋时徽、钦固在也。今海内无主，盍如景泰称制监国』。议乃定。首陈纪纲、法度为立国之本，次及发号、用人二事。又疏陈致治大本，语甚剀切；王嘉纳之。五月三日，王监国。俄有传登极者；盖吕大器以异议惧祸，请登极以自媚也。彪佳曰：『监国名甚正；遽登极，何以服人心、谢江北将士！且今日监国，明日即位，事同儿戏。宜待发丧、除服议之』。乃止。高杰掠扬州，士民奔避，无赖者乘间剽夺。廷议彪佳按吴有威望，命往宣谕；斩倡乱者数人，宣布赦文，甄别有司臧否，一方遂安。
六月，迁大理寺丞，转右佥都御史，巡抚苏、松。先是，北京之变，诸生檄讨其缙绅授伪职者；奸人因之以为利，苏州詹事项煜、大理寺正钱位坤、通政司参议宋学显、礼部员外郎汤有庆四家荡洗无遗。又焚常熟给事中时敏家，三代四棺俱毁。彪佳奏：『民情嚣动，借名义愤。与其振之使惧，不如感之使服；国法既伸，人心自正。宜将从逆诸臣先行处治，使士庶无所借口；则焚掠之徒可加等治』。许之。彪佳复榜诸衢曰：『叛逆不可名，忠义不可矜；毋藉锄逆报私怨，毋假勤王造祸乱』！未几，嘉定华生家奴客勾合他家奴及群不逞近万人，突起劫夺，各暴其主；且踞坐索身券，缚而杖之。彪佳捕斩数人，余尽掩诸狱；令曰：『有原主来保者，得贳死』。于是诸奴抟颡行，丐原主以免；因募士为苍头军。
寻诏复设厂卫缉事官。彪佳上言：『洪武初，官民有犯，或收系锦衣卫，当事者因非法凌虐；高皇帝乃于二十年焚其刑具，送囚刑部：是祖制原无诏狱也。后以锻炼为工、罗织为事，虽朝廷爪牙，实权臣鹰狗；举朝知其枉，而法司无敢雪。惨酷等于来、周，平反从无徐、杜：此诏狱之弊也。永乐间，设立东厂，始开告密。无籍凶徒投为厮养，诬告遍及善良，赤手立致巨万。招承多出于拷掠，怨愤充塞于京畿。欲绝苞苴，而苞苴弥盛；欲清奸宄，而奸宄益多：此缉事之弊也。若夫刑不上大夫，祖宗忠厚立国之本。及逆瑾用事，始去衣受杖。刑章不归司败，扑责多及直臣；本无可杀之罪，乃加必死之刑。血溅玉阶、肉飞金陛，班行削色，气短神摇。即恤录随颁，已魂惊骨削矣。朝廷徒受愎谏之名，天下反归忠直之誉：此廷杖之弊也。三者弊政，当永行禁革』。疏入，群奄共挠之。大学士姜曰广力争之；乃命五城御史察访，不设缉事官。