，未与计偕。明年，张献忠陷衡州，士类多污伪命；其不屈者，投之湘江。先生走匿南岳双髻峰下，贼执其父以为质。先生自引刀刺其肢体，舁往易父；贼见其重创也，免之，父子俱得脱。
十七年，北京陷；先生涕泣不食者数日。明年，王师下金陵，唐、桂二王相继称号；督师何公腾蛟屯长沙、堵公允锡驻常德，两公颇不相能，先生忧之。上书监军章公旷，请调和南北两军，防溃变；章公不能用。诸镇卒奔覆，章公以忧死。
顺治四年，王师下湖南，先生走桂林；大学士瞿公式耜疏荐于桂王，先生以父忧请终制。服阕，授行人。是时桂王建国肇庆，旋移驻武冈，走靖州、柳州，大学士严公起恒皆从；已复从至肇庆。时朝端水火，有吴党、楚党之目。主吴者，为朱天麟、张孝起、吴贞毓、堵允锡、王化澄诸人；主楚者，为金堡、丁时魁、刘湘客、袁彭年、蒙正发诸人。又其时李成栋新附于王，朝政皆决于其子元允，堡等五人附之；吴党目为五虎。严公居其间，不能有所匡正。王在梧州，贞毓等十四人合疏攻五虎，下湘客等于狱，将置之死；先生走告严公曰：『诸臣弃墓坟、捐妻子，崎岖从王；而以党人杀之，则志士将解体，谁与共危亡者』！严公感其言，跽王舟，力救；贞毓等并恶之。是时化澄已为言者劾去，贞毓等请召还；因与合攻严公。先生亦三上疏劾化澄，化澄恚甚，必欲杀先生；以救得免。返桂林，复依瞿公。寻闻母病，间道归；至则母已前卒。
其后瞿公殉节桂林、严公被害南宁，先生知事愈不可为，遂决计老牖下。已而缅甸亦覆没，先生益自悔匿，浪游郴、永、涟、邵间。所至人士慕从，辄辞去。最后归衡阳之石船山，筑土室曰「观生居」，晨夕杜门；学者称船山先生。所着有「周易内传」十二卷、「发例」一卷、「周易大象解」一卷、「周易稗疏」四卷、「周易考异」一卷、「周易外传」七卷、「书经稗疏」四卷、「尚书引义」六卷、「诗经稗疏」四卷、「诗经考异」一卷、「诗广传」一卷、「礼记章句」四十九卷、「春秋稗疏」二卷、「春秋家说」七卷、「春秋世论」五卷、「续春秋左氏博议」二卷、「四书训义」三十八卷、「四书稗疏」二卷、「四书考异」一卷、「读四书大全说」十卷、「说文广义」三卷、「读通监论」三十卷、「宋论」十五卷、「张子正蒙注」九卷、「思问录内篇」一卷、「外篇」一卷、「俟解」一卷、「噩梦」一卷、「黄书」一卷、「识小录」一卷、「老子衍」一卷、「庄子解」三十三卷、「龙溧夜话」一卷、「愚鼓歌」一卷、「相宗络索」一卷、「楚辞通释」十四卷、「姜斋文集」十卷、「诗集」十卷、「诗余」三卷、「诗话」三卷、「外集」四卷、「夕堂永日八代文选」十九卷，共计三百二十四卷。其着录于「四库」者，曰「周易稗疏」、「考异」、「尚书稗疏」、「诗稗疏」、「考异」、「春秋稗疏」凡六种；存目于四库者，曰「尚书引义」、「春秋家说」凡二种。先生论学，以汉儒为门户，以宋五子为堂奥。其所作「大学衍」、「中庸衍」，皆力辟「致良知」之说以羽翼朱子。而于「正蒙」一书，尤有神契；谓『张子之学，上承孔、孟，如皎日丽天，无幽不烛；惜其门人未有殆庶者。而当时钜公如文、富、司马诸公，张子以布衣贞隐，无由资其羽翼；其道之行，曾不逮邵康节之数学！是以不百年而异说兴』。于是究观天人之故，推本阴阳法象之原，就「正蒙」精绎而畅衍之；与自着「思问录」二篇，皆本隐之显原始要终，炳然如揭日月。至其扶树道教，辨上蔡、象山、姚江之误，或疑其言稍过；然议论精严，粹然皆轨于正也。
先生生当鼎革，甲申后，崎岖岭表，发谠论、攻憸邪，备尝艰险。既知事不可为，乃退而著书，窜伏穷山四十余年，一岁数徙其处。故国之戚，生死不忘。康熙十八年，吴逆僭号于衡，伪僚有以劝进表相属者；先生曰：『亡国遗臣，所欠一死耳；今安用此不祥之人哉』！遂逃入深山，作「祓禊赋」。吴逆平，大吏闻而嘉之，属郡守馈粟帛请见；先生以疾辞。未几，卒；葬大乐山之高节里，自题墓碣曰「明遗臣王某之墓」。当是时，海内儒硕推容城、盩厔、余姚、昆山；先生刻苦似二曲，贞晦过夏峰，多闻博学、志节皎然不媿黄、顾两君子。然诸先生肥遯自甘，声望益炳；虽荐辟皆以死拒，而公卿交口、天子动容，其着述易行于世。惟先生窜身猺峒，席棘饴茶，声影不出林莽；门人故旧，又无一有气力者为之表章。殉后四十年，其子敔抱遗书上之督学宜兴潘太史宗洛，因缘得入「四库」。上史馆，立传儒林；而其书仍不传。道光庚子，族孙世佺始刻行。咸丰四年，毁于兵燹；同治二年，曾中丞国荃复捐俸重锓焉。本朝经学家后先生而起者，无虑百十人，所言皆有根柢；然有矜为创获，不知为先生所已言者。「四库总目」于「春秋稗疏」中曾论及之，实未易一二数也。
兄介之，字石子，号石崖。乡举后，值国变，遂隐居不出。先先生卒。着有「周易本义质」四卷、「诗经尊序」十卷、「春秋四传质」十二卷。
子敔，字虎止；操履高洁，博学有文名。康熙朝贡生，与邵阳车无咎（补旃）、王元复（能愚）、攸县陈