察驰扼南坑，出不意击败之，随拔附近各垒；进攻旧市，设左右伏破之。乘胜与松阳、遂昌民团夜袭松阳，复其城。闰八月，自松阳历碧湖、苏埠、白口、大坪、兰埠抵处州，五战皆捷。与各军合攻郡城，贼坚守，炮石雨下；文察与总兵秦如虎攻愈急。贼穷，乘间由东北二门遁，追斩无算；并克缙云。得旨：加提督衔。十一月，移军武义之李村，前军小挫；文察驰至，贼始退。十二月，贼分股距王村、徐村、岭下阳街，来扑李村；文察横陈其师于贼中，贼溃而复至。文察戒各营，俟贼近濠乃击，如是者十余次。最后乃伺其归，开壁逐之，平岭下阳贼垒，王村、徐村贼遁入城。是月，调福建福宁镇总兵。二年二月，克武义；由是，浦江、义鸟贼悉奔渡江。既而绍兴及萧山各匪俱窜徽州，浙东肃清，文察仍军武义。六月，闽浙总督左宗棠以文察廉扑勇敢，奏署福建陆路提督。
八月，嘉义不靖，左宗棠疏言：『台湾一郡远隔重洋，居民多系泉、漳及广东占籍。每村辄筑土围、栽植栗竹，根柢盘固，有碉堡之固而无修筑之劳。枪炮弹丸不能飞入，纵火不能延烧，以故恃险恃富，易肇乱萌。文察隶籍台湾内山，素称能战；请饬酌带本标得力弁兵数百名渡台，号召旧部并统领各军刻期攻剿，以靖海疆』。诏如所请。寻命署理福建水师提督，责令迅速渡台剿匪。旋以文察已携陆路提督印信赴台，命毋庸兼署水师提督。十二月抵台，驰赴嘉义，偕护理水师提督曾元福议进兵。时匪首林戆晟、戴万生等踞彰化及斗六地方，南北间阻，上下百余里皆贼藩篱；文察促曾元福进军石龟溪，亲督游击白瑛等攻斗六。侦知彰化贼以分援斗六势颇张皇，即驰告台湾镇总兵曾玉明等，迅捣彰化；克之。先是，文察派员绅赴各乡开诚劝导，数日间缚献股匪乞免罪者二百数十庄，贼势瓦解。及彰化既复，各匪皆趋斗六，枭贼陈哑狗等踞大突等庄；文察偕曾元福攻拔助匪之三十余庄，直薄斗六土城。贼固垒死守，以附近之小溪洲、鸭母寮等三十余庄为声援；文蔡分军十队，令参将关镇国、游击白瑛、许忠标等约期分出，以大炮击之，各贼局势散分，不能策应。密令军中扬言彰化贼复起，将分兵往剿；次日，拔队行。比夜，偃旗帜，伏蔗林；其留守之关镇国等数营，皆积薪近舍。及晚火起，官军于烟焰中诡作奔窜声及惊惶溃毙状；斗六贼千余来犯，蔗林伏兵潜出其后、曾元福等迎击于前，贼首尾不相顾，官军乘势突入土城，大队继进，斩馘无数，擒伪军师锺合和及逆首蔡四正等，遂拔斗六。戴万生先期奔彰化，与林戆晟煽胁各庄；文察移师彰化申谕之，又运粮赈粜以安民心。三年正月，复破樵溪口等数十庄，擒匪首林传等二十余人，戮之。戴匪窜张厝庄，联目宜山红毛社等匪巢四十余负嵎抗拒；文察檄兵团连毁其五巢，谕贼党擒万生至，诛之。而林戆晟踞四块厝老巢，外列层楼、内置大炮，树密径险，攻之不下。乃四围筑炮台环击之，犹不下；因觅敢死者五人，夜潜入贼垒，塞其炮门。迟明，各军鼓噪进，用火攻；贼惊窜，林戆晟伏诛。四月，左宗棠奏调文察内渡剿贼。五月，彰化逸贼复结党围县城，文察一战解之。七月，台湾道丁日健劾文察家居五十余日顿兵不出，扎营彰城，兵勇骚扰，绅民怨恨；谕敕左宗棠等确勘。八月，疏言；『文察以余匪复炽，诿过于地方官；文武意见不合，互相攻讦。文察回内山，至今亦未内渡。请先行交部议处』。十月，文察驰抵福州，巡抚徐宗干疏称：『文察赴调延缓，实因夏秋每多飓暴，重洋阻滞。见巳星赴邵武、汀州一带，相机堵剿，应请敕部免议』。从之。
文察之内渡也，仅带旧勇二百人，请增兵于徐宗干。兵未集而江西败匪窜云际关，偪近闽疆，即日拔队趋邵武。寻漳州陷，宗干檄文察回扼泉州、龙岩州境。文察以州属之漳平、宁洋与永春、大田、永安路路可通，虑贼乘虚内窜，分队取道安溪赴宁洋；宗干复促文察统领全部，由同安规取漳州。于是沿途调募兵勇，至十一月驻军洋洲，距漳州三十里；贼已西陷武平、永定，南窜平和、云霄，北扰南靖、龙岩，所在披猖矣。文察派游击许忠标扼南路，以守备林向日率舟师泊湘桥应之；游击林祟春扼东路，已革副将惠寿等驻赤岭万松关应之；守备黄益龙协守安溪；调厦勇赴漳平以御北窜。十二月，惠寿营先陷，文察退屯玉洲。寻出队响水桥，获小胜，立营万松关；贼先出数千人来拒，击走之。旋大股数万至，文察督勇奋击，鏖战五时，贼围愈密，寡不敌众；文察跃马挥刀，手刃数贼，突围不能出，中鎗殁于阵。左宗棠疏言：『文察此次内渡，仓猝调集，兵将两不相习。前檄令力保泉、厦，并未敢责以规复漳州。旋闻其已进万松关，距漳郡仅二十余里，复饬其深沟固垒，勿浪战求胜；俟浙军到后，协力并规，乃为稳着。不料其急于趋战，致有此失』。徐宗干疏言：『文察壮年英勇，节次在闽、浙各处带兵剿匪出力，身先士卒，所向有功。今寡不敌众，血战捐躯，实堪悯惜』！旋赠太子少保衔，予谥「刚愍」，赏骑都尉世职兼一云骑尉。光绪四年，漳州绅士呈请建立专祠，奉旨允准。十六年，福建台湾巡抚刘铭传以文察功在桑梓，请于本籍台湾省城建立专祠，由地方官