酌减条款，虽通商各条所争回者甚为有益，惟两大款关系最重。赔费已减三分之一，若能再与磋磨，减少若干，更可稍纾财力；让地一节，台、澎竟欲全占，奉省所退无几，殊觉过贪。前电姑许矿利，该大臣虑其不允；为今之计，或允其割台之半。以近澎台南之地与之；台北与厦门相对，仍归中国。奉天以辽河为三省贸易出海之路，牛庄、营口在所必争。着该大臣将以上两节再与竭力辩论，冀可稍益大局。伊藤连日词气极迫，倘事至无可再商，应由该大臣一面电闻、一面即与定约。该大臣接奉此旨，更可放心争论，无虞决裂矣』。
辛卯（二十日），李鸿章电致总理各国事务衙门：『顷接啸电，奉旨敬悉。伊藤十七晚送到「哀的美敦」书，词已决绝，无可再商。昨虽覆函略加驳论，必置不理。即使会晤再行磋磨，割台之半与之，亦必不允；一岛两国分治，口舌既多，后患亦大。至奉省割界至营口，牛庄已不在内；营口水利岂能遽舍！此皆不妨辨论及之，实恐难望转圜。且停战第六款内称「如期和议决裂，此约亦中止」云；若议不合，必至决裂。察看近日日人举动，已遣运兵船二十余艘由马关出口赴大连湾，并令法、美观战探事人随队往前敌，其意可知；恐非即与订约不可，不得不先奏明』。又电：『顷派伍廷芳往伊藤处告知：总署已电饬前敌将帅勿再违约。据伊面称：华军不谙公法，动辄妄为；恐不待停战期满，已先开仗。并催允定和约覆信，谓「广岛已派运兵船三十余艘出口赴大连湾，小松亲王等明日督队继进；若再商改约款、故意迟延，即照停战款内和议决裂，此约中止办法」等语。是其愈逼愈紧，无可再商。应否即照伊藤前所改订条款定约，免误大局？乞速请旨电饬遵办」。上谕军机大臣等：『李鸿章十九日电均悉。十八日所谕各节，原冀争得一分有一分之益；如竟无可商改，即遵前旨与之定约』。
甲午（二十三日），李鸿章与日本全权大臣伊藤博文等在马关议定和约十一款、另约三款成。其文曰：『第一款，中国认明朝鲜国确为完全无缺之独立自主，故凡有亏损独立自主体制——即如该国向中国所修贡献典礼等，嗣后全行废绝。第二款，中国将管理下开地方之权并将该地方所有堡垒、军器、工厂及一切属公对象，永远让与日本：一、下开划界以内之奉天省南边地方，从鸭绿江口溯该江以抵安平河口，又从该河口划至凤凰城、海城及营口而止，划成折线以南地方，所有前开各城市邑皆包括在划界线内。该线抵营口之辽河后，即顺流至海口止，彼此以河中心为分界。辽东湾东岸及黄海北岸在奉天省所属诸岛屿，亦一并在所让境内。二、台湾全岛及所有附属各岛屿。三、澎湖列岛——即英国格林尼次东经百十九度起至百二十度止及北纬二十三度起至二十四度之间诸岛屿。第三款，前款所载及粘附本约之地图所划疆界，俟本约批准互换之后，两国应各选派官员二名以上为公同划定疆界委员，就地踏勘，确定划界。若遇本约所订疆界于地形或治理所关有碍难不便等情，各该委员等当妥为参酌更定；各该委员等当从速办理界务，以期奉委之后限一年竣事。但遇各该委员等有所更定划界，两国政府未经认准以前，应据本约所定划界为正。第四款，中国约将库平银二万万两交与日本，作为赔偿军费。该款分作八次交完，第一次五千万应在本约批准互换后六个月内交清、第二次五千万两应在本约批准互换后十二个月内交清；余款平分六次、递年交纳，其法列下：第一次平分递年之款于两年内交清、第二次于三年内交清、第三次于四年内交清、第四次于五年内交清、第五次于六年内交清、第六次于七年内交清，其年分均以本约批准互换后起算。又，第一次赔款交清后，未经交完之款应按年加每百抽五之息。但无论何时将应陪之款或全数、或几分先期交清，均听中国之便。如从条约批准互换之日起三年之内能全数清还，除将已付利息或两年半、或不及两年半于应付本银扣还外，余仍全数免息。第五款，本约批准互换之后，限二年之内日本准中国让与地方人民愿迁居让与地方之外者，任便变卖所有产业退去界外；但限满之后尚未迁徙者，酌宜视为月本臣民。又，台湾一省，应于本约批准互换后，两国立即各派大员至台湾，限于本约批准互换后两个月内交接清楚。第六款，中、日两国所有约章，因此次失和，自属废绝。中国约俟本约批准互换之后，速派全权大臣与日本所派全权大臣会同订立通商行船条约及陆路通商章程。其两国新订约章，应以中国与泰西各国现行约章为本。又本约批准互换之日起、新订约章未经实行之前，所有日本政府官吏臣民及商业工艺、行船船只、陆路通商等，与中国最为优待之国礼遇护视一律无异。中国约将下开认与各款，从两国全权大臣画押盖印日起六个月后方可照办：第一，现今中国已开通商口岸之外，应准添设下开各处立为通商口岸，以便日本臣民往来侨寓，从事商业工艺制作。所有添设口岸，均照向开通商海口或向开内地镇市章程一体办理；应得优例及利益等，亦当一律享受。一、湖北省荆州府沙市，二、四川省重庆府，三、江苏省苏州府，四、浙江省杭州府：日本政府得派遣领事官于前开各口