刑部治罪，并撤回李经方，革职严办。一面饬王文韶、刘坤一妥备战守，奖励裕禄、唐景崧等以安人心；一面明发谕旨宣示中外，奉皇太后西幸，命恭亲王留守京师。如战而不胜，赔款、割地尚为未迟。战而糜款，犹胜于和而赔款；战而失地，犹胜于和而割地。如因或迁、或守而致贻误大局，请先诛微臣以谢天下。皇上为英主、为孱主，中国为强国、为弱国，本朝为大朝、为小朝，诸臣为贞臣、为邪臣，皆视此一举；微臣不胜迫切待命之至』！上谕军机大臣等：『近自和约定议，廷臣文章论奏，谓地不可弃、费不可偿，仍行废约决战，以冀维系人心、支撑卮局；其言固出于忠愤，而于朕办此事熟筹审处不获已之苦衷有未深悉者。自去岁仓卒开衅、征兵调饷，不遗余力；而将少宿选、兵非素练，纷纷招集，不殊乌合：以至水陆交绥，战无一胜。近日关内外情事更迫，北则紧逼辽渖、南则直犯畿疆，皆现在意中之事。沈阳为陵寝重地，京师则京社攸关；况二十余年来慈闱颐养，备极尊崇。设使徒御有惊，则藐躬何堪自问！加以天心示警，海啸成灾；沿海防营，多被冲没：战守更难措手。是用宵旰旁皇，临朝痛哭；将一和、一战两害兼权，而后幡然定计。其万分为难情事，言者章奏所未及详，而天下臣民皆当共谅者也。兹将批准定约，特将先后办理缘由明白宣示。嗣后我君臣上下，惟期坚苦一心，痛除积弊。于练兵、筹饷两大端实力研求，亟筹兴革；毋生懈志、毋骛虚名、毋忽远图、毋沿积习，务期事事核实，以收自强之效：朕与内外诸臣有厚望焉』！
丙辰（十五日），谕军机大臣等：『昨有旨令龚照瑗回英；现于十四日亥刻烟台换约，此次争回全辽，三国极为尽力；如龚照瑗已回伦敦，即着庆常赴法廷传旨先行致谢』。
丁巳（十六日），谕军机大臣等：『伍廷芳电称：「日使送还照会三件，未经带去」。着李鸿章即将前二件电知伊藤以为根据，其后一件毋庸再电。现惟台事极为棘手，李鸿章前电「伊藤有另行筹商」之语，究竟有何办法以免内变外衅之虞？着悉心筹划具奏。依克唐阿电奏：一十一午后，我军在长岭子驻守，遥见日兵三、四十名直奔岭下。我军因巳逾照会界限，向前摇手阻拦；日兵不听，忽以三骑冲上岭腰开鎗，步队踵接其后。我军祇得开鎗抵御，中日一骑，始退去。十二辰刻，复来马、步三百余名，我军已列阵预备」等语。停战期内，无故越界开鎗，实属违约；其曲在彼。着李鸿章一并电告日本，饬彼驻辽各军勿再越界生事为要』。
辛酉（二十日），李鸿章电致总理各国事务衙门：『顷接伊藤博文十八日戌正电称：「十七日来电收到。日本一俟应先预备之事整办之后，即可与中国开议奉天南边之地。至台湾一节，日本现已告明中国政府：今日皇巳派水师提督子爵桦山资纪作为台、澎等处巡抚并作为日本特派大员，办理按照「马关和约」第五款末款之事。约两礼拜，该巡抚即可履任办事；于行抵该处时，即预备办理特派之事。日本政府盼望中国政府立即简派大员一人或数人与该巡抚会晤，并将该大员等衔名告明日本政府。按照如此情形，本大臣告知贵大臣：日本政府谓如中国政府查照日本所请速派大员一人或数人与该巡抚桦山会晤、毫无延宕，则贵大臣所虑危险之事即可免矣。该巡抚一经到任之后，则境内保全平安之事，一惟日本政府是问」等语。玩其语意，似已电由田贝告知钧署。适科士达来晤，密与商筹；科谓「和约既经批准互换，除日本允还奉天南边另议外，其余应逐一照办；断不可游移、借故诿延，以致另起波澜，生出意外危险。即请他国保护即使办到，亦必枝节横生」。鸿告以「台湾官兵不肯交接，奈何」？科谓「皇上批准，中国官民岂可任听梗阻，致失国体！如国家采纳鄙言，应由政府属田贝转告日本：以中国派大员商交台湾，日本应同时派大员商交辽东，方为公允」云云。可否仍责成唐署抚与日员妥为商办？乞代奏请旨』。上谕军机大臣等：『李鸿章奏「恳请续假」折，着再赏一个月调理。又据电奏，接伊藤电称：「日本已派桦山资纪办理台湾之事」。惟现在台湾兵民交愤，必不甘服听命。无论唐景崧系守台之官，万无交台之理；况现为台民迫留、危在旦夕，亦无权与之交割。李鸿章前电「伊藤有重为虑及、另行筹商」之语，今伊藤来电祇云「中国派员与桦山会晤，所虑危险之事可免」；其不受商量，巳可概见。台湾如此情形，该大臣设身处地，将何以措置？前所谓另行筹商者，究竟有何办法？如何补救？着妥筹覆奏。刘含芳电称「烟台俄舰已有十五艘」；此外尚有何国兵船若干停泊？着该道随时探闻』。
癸亥（二十二日），谕军机大臣等：『前据龚照瑗电称：「探闻法与他国密议台事，暂不使华与闻生枝节」等语。台民汹汹，势难交割；刻下日本派员已将到台，办理殊为棘手！即着庆常密询外部「能否再践护台前议」？迅速电覆。再，法使有「外部不愿接见王之春」之语；究竟曾否会晤？着一并电闻』。
甲子（二十三日），张之洞电奏：『顷接台民二十一日公电云；「全台绅民敬电禀者：台湾属日，万姓不服，迭