（初八日），我大清兵取上蔡。
壬辰（初九日），以耿廷箓为都察院右佥都御史，巡抚四川。命百官会审北来太子于午门外。闯贼寇潜江。河南有妇人童氏自称王邸元妃，巡按御史陈潜夫具仪从送至京；上怒，下童氏锦衣卫狱，并逮潜夫。
癸巳（初十日），遥祭诸陵。
乙未（十二日），阮大铖荐马士英之子锡为京营总兵官。
戊戌（十五日），命黄斌卿以原官挂征蛮将军印，镇守广西；方国安挂镇南将军印充总兵官，驻防池口。
己亥（十六日），徙崇王慈爚居福州。上懿安皇后谥曰「孝哀慈靖、恭惠温贞、偕天协圣哲皇后」，更恭皇帝谥曰「孝皇帝」。命黄得功移镇庐州，与刘良佐合力防御。
壬寅（十九日），思宗忌日，上于宫中举哀；百官于太平门外设坛遥祭，以东宫、二王祔。
癸卯（二十日），命三法司覆审北来太子等。黄得功、刘良佐、左良玉、何腾蛟、袁继咸各疏论北来太子事；良佐疏兼及童氏事，言上为群臣所欺，将使天伦绝灭。上曰：『朕元妃黄氏，先朝册封，不幸夭逝；继妃李氏，又已殉难。登极之初，即追封后号，诏示海内。卿为大臣，岂不闻知！童氏不知何处妖妇，诈冒朕妃。朕初为郡王，有何东、西二妃？据供是邵陵王宫人，尚未悉真伪。王之明是驸马王昺之侄孙，避难南来，高梦箕家丁穆虎教令冒认东宫：正在严究。若果真实，朕于夫妻、伯侄之间岂无天性，况宫媵相从患难者颇多。朕于先帝无纤芥之嫌，因宗社无主，不得已从群臣之请，勉承重寄；岂有利天下之心，忍加毒害于其血脉！至于举朝文武，谁非先帝旧臣、谁不如卿？肯昧心至此！朕夫妻之情，又岂群臣所能欺蔽！但太祖之天潢、先帝之遗体，不可以异姓顽童渎乱宗祏；宫闱风化所关，岂容妖妇阑入！国有大纲、法有常刑，卿不得妄听妖讹，猥生疑议』！因命法司将二案审明情节传示中外，以释群疑。时流言益甚，史可法疏请召对，以息群嚣；上谕止之。封外戚黄九鼎为雒中伯。加朱大典兵部尚书兼右副都御史，巡抚应天。
乙巳（二十二日），我大清兵取归德，巡按御史凌駉及其从子润生死之。
丁未（二十四日），许罪废诸臣输银复官。
戊申（二十五日），左良玉举兵反，焚武昌东下。
己酉（二十六日），以钱继登为都察院右佥都御史，总理两淮盐法兼督江防。罢巡盐御史。
壬子（二十九日），我大清兵取颍州，复取太和县。王永吉请饬史可法、卫胤文共保徐州，士英不听。加李本身太子太保、左都督。遣使册封琉球国王。
是月，川省督师王应熊、总督樊一蘅、摄巡抚马干、参政刘鳞长、副将曾英、朱化龙、同知詹天颜、宗室进士朱奉■〈金尹〉、举人郑延爵、武进士杨展、土司杨之明、马京、马亭各起兵讨献贼，收复州县；献贼乃大杀四川绅士及其伪官。
夏四月癸丑朔，御史毕十臣奏：孟夏时享太庙，陪祀官多不至者。以左兵东下，命史可法督诸军渡江入援。
丙辰（初四日），左良玉兵陷九江，寻死，其子梦庚自称「留后」；命阮大铖、刘孔昭帅师御之。左梦庚兵陷建德。
戊午（初六日），陷彭泽；己未（初七日），陷东流。命阮大铖会同黄得功堵剿。
庚申（初八日），光时亨、周锺、武愫伏诛；同日赐周镳、雷演祚自尽。
辛酉（初九日），黄得功驻兵荻港。是日，我大清兵自归德分道南下，总兵李成栋遁；遂入徐州。
壬戌（初十日），封常澄为襄王，居汀州。黄斌卿败左兵于铜陵。
乙丑（十三日），左梦庚兵陷安庆。
是日，我大清兵取泗州。丙寅（十四日），渡淮。史可法退保扬州，连章告急；言『上游不过欲除君侧之奸，未敢与君父为难；北兵一至，则宗社可虞』！大理寺卿姚思孝、工科吴希哲请备淮、扬；上谕士英曰：『良玉虽不应兴兵，然看他本上，原不曾反。淮、扬急，则赴淮、扬』。士英厉声指诸臣曰：『此皆良玉死党为游说；我君臣宁死于清，不可死良玉手』！上无如何也。时高营溃兵掠舟渡江，命杨文骢、郑鸿逵炮击之；溃兵进退无所，遂降于我大清。
丁卯（十五日），选淑女于元晖殿；京师女七十人中阮姓一人、浙女五十人中王姓一人。
戊辰（十六日），命潞王常淓移驻湖州，周王恭枵、鲁王以海移驻江西、广东。
己巳（十七日），以刘洪起为提督汝宁、开封等处总兵官；时河南尽失，洪起独支持光、黄间。
庚午（十八日），命王永吉总督防河、钱继登兼抚扬州。左梦庚兵至池州。
壬申（二十日），诏暴左良玉罪状。总兵郑鸿逵奏：破高杰营乱兵于江中。我大清兵围扬州；刘泽清假入援，大掠而东。
丙子（二十四日），以霍达为都察院右佥都御