清顺治二年（乙酉）春正月乙酉朔，日有食之。是日，大雪。上在南京，称弘光元年；免朝贺。
庚寅（初六日），以新殿推恩，加史可法太师兼太子太师、建极殿大学士，马士英少师兼太子太师、中极殿大学士，王铎少保兼太子太保、武英殿大学士；予荫。以士英掌文渊阁印，充首辅辨事。可法辞太师，许之。
壬辰（初八日），立春。流星入紫微垣。
癸巳（初九日），大雷电，雨雹。命黄得功、刘良佐进屯颍、亳，皆受命不行。高杰提兵直抵关、雒，进据虎牢。
乙未（十一日），解学龙再上从逆诸臣罪案兼请停刑，许之。是日许定国诱杀兴平伯高杰于睢州。
丙申（十二日），杰部将攻睢州，定国遂叛降于我大清。
戊戌（十四日），禁宗室入京朝见。
壬寅（十八日），命在京诸臣自陈。
癸卯（十九日），以吏部左侍郎蔡奕琛兼东阁大学士，入阁办事。
甲辰（二十日），命删定「三朝要典」。
乙巳（二十一），朱国弼、张孙振劾解学龙党从逆；夺学龙职。召前都察院左都御史唐世济以原官管右都御史事。
庚戌（二十六日），命武臣自公侯伯以下非赐肩舆并骑马、坐蟒，斗牛非奉赐，麒麟、白泽非勋爵，不许借用。
辛亥（二十七日），加监军侍讲卫胤文兵部右侍郎，总督高杰标下镇将兵马，经略开、归。兵部尚书张国维乞归省，许之。
是月，我大清兵取西安，李自成走襄阳。
二月乙卯（初二日），命清厘滥冒勋卫。
丙辰（初三日），以王骥为都察院右副都御史，巡抚湖广。
戊午（初五日），以高倬为刑部尚书。以阮大铖为兵部尚书兼都察院左副都御史，协理部事，仍巡视江防。命太监李国辅开采云雾山，给事中吴适疏谏不听；寻报罢。巡按浙江御史彭遇颽为民所逐，命改调淮、扬。加盐课引五分。
甲子（十一日），谥思宗皇太子曰「献愍」、定王曰「哀」、永王曰「悼」。
乙丑（十二日），遣黄道周祭告禹陵。史可法请用高杰部将李本身为提督，不许。黄得功引兵趋扬州；遣卢九德宣谕解之曰：『大臣当先国事而后私雠；黄得功若向扬州使高营将士弃汛而东，敌人蹑之南下，谁执其咎？朕于诸藩恩礼有加，诸藩亦当恪守臣节，勿轻举以误国家』！得功不得已，引还。裁九江额饷六万，总督袁继咸争之，不听；请罢，亦弗许。
丙寅（十三日），命于苏州织造大婚冠服。张孙振奏劾礼部尚书顾锡畴并论夺温体仁谥事。
丁卯（十四日），锡畴罢。荫方孝孺裔孙五经博士。前山西殉难巡抚蔡懋德子方熺疏请恤典，不许。赠伏法太监刘元斌、王裕民祭葬，予「逆案」徐大化、徐景濂、刘廷元等恤典。
癸酉（二十日），撤高杰兵回，命刘良佐防归德；遣太监高起潜安抚杰营将士驻扬州。时武臣借口助饷，往往破人产。延陵朱一冯者，已革巡抚也。富而吝，里人诉之。上以一冯身为大臣，多藏厚亡，大丧缙绅之体；命察其田产。又谕部臣曰：『捐助原听民乐输、抄没乃朝廷偶行，岂刁民献媚之事？宗藩勋戚须敬礼士大夫，与地方相安，不得非法罔利』！钦天监奏日月色甚赤；上曰：『是何分野、何无占候？其访术者举用』。
甲戌（二十一日），进蔡奕琛礼部尚书兼文渊阁大学士。
乙亥（二十二日），追封弟由榘颍王，谥曰「冲」。
丙子（二十三日），改上思宗庙号曰「毅宗」。封慈爚崇王。赠死事武臣沈寿崇、知府王行俭、知县李允在等官荫。
丁丑（二十四日），止滇、黔援兵。御史袁宏勋疏攻袁继咸，左良玉救之，并言「要典」宜焚。上谕曰：『此朕家事，列圣父子兄弟之间数十年无纤毫间言，诸臣妄兴诬构；卿一细阅，亦当倍增悲愤。但与见在廷臣无关，悉从宽宥，不必疑猜』！
戊寅（二十五日），李自成走承天。
己卯（二十六日），铸各衙门印，去「南京」字。
是月，闯贼复犯郧阳，守将王光恩御却之。
三月乙酉（初二日），僧大悲伏诛。
丁亥（初四日），命王永吉带抚淮、安，卫胤文兼抚徐、扬。复温体仁谥荫。召勋臣朱国弼等、阁臣马士英等、翰林刘正宗等入见武英殿，面谕同府部、九卿、科道辨验北来太子真伪。日午，群臣奏『系故驸马都尉王昺侄孙王之明，曾侍卫东宫；家破南奔，鸿胪少卿高梦箕家丁穆虎教之诈称太子』。乃下中城兵马司狱。即擢杨维垣为都察院左副都御史。
戊子（初五日），以太监乔上总理两淮盐课。
己丑（初六日），我大清兵取郾城，又取西平。闯贼逼承天，左良玉遣使告急；命督臣何腾蛟御之。
辛卯