皇考福恭王曰「贞纯肃哲、圣敬仁懿恭皇帝」，皇妣姚氏曰「孝诚端惠、慈顺贞穆皇太后」。遥上皇生母邹氏尊号曰「恪贞仁寿皇太后」。追谥元妃黄氏曰「孝哲懿庄、温贞仁靖皇后」，继妃李氏曰「孝义端仁、肃明贞洁皇后」。
庚申（初四日），颁河北、山东诏。
壬戌（初六日），召「逆案」阮大铖冠带陛见。户科给事中罗万象、御史王孙蕃、陈良弼、大理寺丞詹兆恒、应天府丞郭维经、怀远侯常延龄等交章谏，宏图请九卿议，与士英忤；曰广以中旨用人争之，不得。各疏求去，不许。吕大器劾士英卖官鬻爵罪，不听。刘良佐率兵攻临淮不克，移驻寿州。兵科给事中陈子龙疏请兵部主事何刚练水师，从之。命议殉难从逆诸臣功罪。
甲子（初八日），献贼陷涪州。
乙丑（初九日），命惠王常润移居肇庆。吉王□□薨。
丙寅（初十日），起钱谦益为礼部尚书协理詹事府事。吏部尚书张慎言罢。礼部请立中宫；诏以列圣先帝之雠未报，不许。命万元吉再往扬州、六合调辑军民。
己巳（十三日），以吴志葵镇守吴淞。刘泽清来朝，疏纠吕大器、雷演祚荐张捷、邹之麟、张孙振、刘光斗等；未几，大器罢。
癸酉（十七日），詹兆恒进钦定「逆案」，马士英亦于是日进「三朝要典」。
乙亥（十九日），追复懿文皇太子庙号「兴宗孝康皇帝」，妃常氏谥「孝康皇后」。追崇建文帝谥曰「嗣天章道、诚懿渊恭、觐文扬武、克纯笃孝让皇帝」，庙号「惠宗」；后马氏曰「孝愍温贞、哲睿肃烈、襄天弼圣让皇后」。追崇恭仁康定景皇帝谥曰「符天建道、恭仁康定、隆文布武、显德崇孝景皇帝」，庙号「代宗」；贞惠安和景皇后汪氏曰「孝渊肃懿、贞惠安和、辅天恭圣景皇后」。
丁丑（二十一日），左懋第疏请北行。献贼陷重庆，瑞王常浩并原任巡抚陈士奇等皆遇害。赠死难沭阳知县刘士燝山东佥事。巡按湖广御史黄澍入贺，面纠马士英罪；士英免，寻复令视事。
戊寅（二十二日），封福府千户常应俊为襄卫伯，世袭。
己卯（二十三日），赵之龙纠高宏图议思宗庙号之失，请改正；诏仍旧。
庚辰（二十四日），以徐石麒为吏部尚书，何应瑞为工部尚书。京口兵哄，诏督师核治；嗣后兵将调集，听本处抚臣节制。
辛巳（二十五日），命王燮为都察院右佥都御史，巡抚山东。
壬午（二十六日），顾锡畴请追谥文震孟等而夺温体仁谥，并从之。
癸未（二十七日），我大清兵取德州，前大学士谢升、御史赵继鼎、卢世■〈氵隺〉迎降。
甲申（二十八日），以邱磊为山东总兵官。赠死事原任吏部员外郎程良筹光禄寺少卿、举人刘申锡知州、生员杨之金教授，祠名「义烈」。以黄斌卿防御京口。调郑芝龙兵六千入卫。
乙酉（二十九日），命鲁王以海暂驻处州、崇王□□斩驻台州。
秋七月丙戌朔，祀高皇帝以下于奉先殿，以大行皇帝、皇后祔祭。加张慎言、程注太子太保，予荫。
丁亥（初二日），给事中章正宸疏陈时事、建宁知县蒋芬自请勤王，俱不报。
庚寅（初五日），以左懋第为兵部右侍郎兼都察院右佥都御史，经理河北、联络关东军务；马绍愉为太仆寺少卿兼兵部职方司郎中，加陈洪范太子太保：赍白金十万两、金千两、缎绢万匹，出使于我大清。金声桓驻防扬州。
壬辰（初七日），定守护凤陵戍兵五千人。以刘之勃为都察院右佥都御史，巡抚四川。
甲午（初九日），以六等定从逆诸臣罪。其大逆凌迟处死者五条：凡从贼攻陷京师及为贼毁宗社、易门榜者；凡倡率劝进及为贼草伪诏者；凡部院、詹事、翰林三品以上大臣，从贼受伪命而亲信用事者；凡文武封疆大吏，如督、抚、总兵降贼者；凡京堂、科、道部属等官为贼画策规取地方者。以上如本犯不归、归而又逃，悉收系其妻子、籍没其家产。其斩决不待时者三条：凡四品京堂及翰、詹、科、道受贼伪命、居要地比原职加崇者；凡方面分巡、分守、知府等官降贼者；凡文武封疆大吏闻变先逃者。其绞者六条：凡献玉帛、献子女以媚贼求免者；凡内外衙门官仅受伪命者；凡在巡方及布按三司、分巡、分守、知府等官遇变而逃者；凡被贼拷掠不能自决，仍受伪命者；凡受伪命而为贼疏远者；凡管屯、管河、榷关、督饷等官，虽无封疆之守而弃职潜逃者。其流者二条：凡内阁重臣及部院等三品以上、詹事翰林五品以上，即不从贼而偷生潜逃者；凡既受伪命复自疏远，见贼未败而脱身南还者。以上斩、绞、流共十一则，如各犯认罪自投，拟减本罪一等；如遁归匿形，蓄谋叵测，照本罪加一等，仍收系其亲属。其徒者二条：凡候考、候选即无官守即未受伪命而浮沈贼中，贼奔乃还者；凡遇贼变为贼胁留而未受伪命者。其杖者一条：凡为贼所拘，未受伪官