后宫坐定。杜荷曰：“殿下知魏王泰有夺嫡之意乎？”太子佯应曰：“不知也。”荷曰：“外议纷纷，不久为乱矣。太子犹自不知乎？”太子见其情实，乃谓之曰：“魏王果起谋意，欲夺我位，今知之数日矣。”因令君集、安俨等与杜荷相见，具所以谋反之意。杜荷曰：“太子此事，且秘而勿发。洋州刺史赵节，吾之故人，见掌十二万雄兵。太子先遣人约之日期，以为外应。今魏王有大权。若知此谋，因而作乱，将何以处之？殿下遇天文有变，当速发。勿被他人所制。但诈称疾病危笃，主上必亲临看视。因其来，乘机图之，国事遂定。然后收魏王等诛之，有何难哉！”太子然之，乃厚赂众人。众人各割臂为誓而散。
过二日，太子之谋已露。中官上变，告于太宗，太宗惊曰：“东宫的有是事，国家乱无日也。”即敕大理、中书、门下参鞠之。有司鞠审太子反状已具，入奏，上大怒，召太子至金阶下，面责之曰：“吾以汝为嫡子，而有东宫之命。不思王业艰难，专事失德之行。今越分过求，先起不轨谋，何以安人民社稷乎？”承乾曰：“臣为太子，志已足矣，复何所求哉。但为泰所图，时与朝臣谋自安之术。不忠之人，遂教臣为不轨耳。今陛下若立泰为太子，所谓落其度内也。”言罢，顿首涕泣，上乃谓侍臣曰：“将何以处承乾？”群臣莫对。通事舍人来济进曰：“东宫之罪虽有，陛下不失为慈父，太子得尽天年，亦天下之公议也。”上从之，诏废承乾为庶人，幽于禁宫，不许辄出入。汉王元昌赐死，侯君集、安俨、节、荷等，以通同太子谋反，尽伏诛。庶子张玄素以不谏诤，罢职为民。独于志宁以数谏于太子有功，褒美之。
是时上发落已定，侯君集临刑，遣家人上表，诉其有大功劳，乞留性命。上览表谓侍臣曰：“君集有功，欲乞其生，可乎？”群臣皆曰：“君集谋反已露，陛下罪之当矣。若复赦宥，何以服他人？”上乃泣曰：“传与君集，朕将与之长诀矣。”遂斩之。上以承乾既得罪见废，魏王泰日入侍奉。上面许立为太子。岑文本、刘泊等亦劝之曰：“魏王好仁爱下，深得内外心。若使承统，社稷之福也。”长孙无忌固请立晋王治，上谓侍臣曰：“昨日青雀投我怀云：‘臣今日始得为陛下子。臣有一子。若死之日，当为陛下杀之，而绝争兢。’令传位晋王，朕甚怜之。”谏议大夫褚遂良曰：“陛下失言矣。此国家大事，存亡所系，愿熟思之，直陛下万岁后，魏王据有天下之重，肯杀其爱子以授晋王哉？陛下前者以嫡庶之分不明，致此纷纭。今必立魏王，愿先措置晋王，始得安全耳。”上流涕曰：“卿之言，实切我心。今日之事，吾不能也。”因起入宫，侍臣随之。
先是魏王泰恐上立晋王，先以计惑之，因谓晋王治曰：“汝与汉王元昌相善，今元昌虽得罪赐死，汝亦无忧乎？”治曰：“吾每怀之。今其死，安得无忧？”于是晋王见上忧形于色，上屡怪之，因问曰：“卿以何事不足，见寡人常有弗愉色也？”晋王治对曰：“臣职为王，无有不足。特以元昌得罪赐死，臣甚怜之，致有此忧也。”是时太宗亦以元昌不预太子之谋，既赐其死，甚有悔心。及闻晋王之言，始觉晋王有友爱之亲，乃怃然悔立魏王之言矣。因独留长孙无忌、房玄龄、李世勣、褚遂良谓曰：“我三子一弟，所为如是，我心诚无聊赖！”因自投于床，拔所佩刀，欲自刎。褚遂良急向前夺刀，度与晋王。无忌等曰：“请陛下所欲立谁为太子，异议自定。”上曰：“我欲立晋王。”无忌曰：“谨奉诏命。”上乃使治拜无忌曰：“此汝舅许汝矣。”上出御太极殿，召群臣谓曰：“前太子承乾悖逆。魏王泰亦凶险。诸子谁可立者？”众皆欢呼曰：“晋王仁孝，当为嗣。”太宗大悦，即立晋王治为皇太子，时年一十六岁。
群臣各上表称贺。太宗因谓侍臣曰：“我若立泰为东宫，则是太子之位，可经营而得。自今太子失道，藩王窥伺者，皆两弃之，不许复有其位。传诸子孙，永为后法。且泰立则承乾与治皆难保全。今治为太子，则承乾与泰皆无恙矣。”无忌等拜曰：“陛下之见甚明，自是可以绝祸乱矣。”上乃降泰爵为东莱郡王，幽之北苑。其府僚、亲狎者，皆迁岭表。司马温公曰：唐太宗不以天下大器私其所爱，以杜祸乱之源，可谓能远谋矣。太宗以太子之位既定，诏长孙无忌为太子太师，房玄龄为太傅，萧瑀为太保，李世勣为詹事。瑀、世勣并同中书门下三品。又以李大亮、于志宁、马周、苏最、高季辅、张行成、褚遂良皆为僚属。
世勣尝得暴疾，医者云：“得须灰可疗。”上闻之，自剪须与之和药，又尝从容谓世勣曰：“朕求群臣可托幼孤者，无以逾公。公往不负李密，岂负朕哉？”世勣流涕辞谢，齿指出血。是时，黄门侍郎刘泊言：“太子宜勤学问，亲师友。今入侍宫闱，动过旬朔不出，师保以下接对甚少。”上是其言，乃命泊与岑文本、褚遂良、马周至东宫，与太子游。自是，上见太子，遇物则诲之。见其饭则曰：“汝知稼穑之艰难，则常有斯饭矣。”见其乘马，则曰：“汝知其劳而不竭，则常得乘之矣。”见其乘舟，则曰：“水所以载舟，亦所以覆舟。民犹水也，君犹舟也。