以次编改。此外凡与司法行政无甚关系各署，一律照旧。第二，此次立定官制，总使官无尸位，事有专司，以期各有责成，尽心职守。第三，现在议院遽难成立，先就行政、司法厘定，当采用君主立宪国制度，以合大权统于朝廷之谕旨。第四，钦差官、阁部院大臣、京卿以上各官，作为特简官，阁部院所属三四品人员，作为请简官；阁部院五至七品人员，作为奏补官；八九品人员，作为委用官。第五，厘定官制之后，原衙门人员，不无更动或至闲散，拟在京另设集贤资政各院，妥筹位置，分别量移，优予俸禄。
旨意下来，着即按照陆续筹集，详加编定。起草课各委员奉到此旨，顿时就忙起来，终日伏案埋头，精心编撰。不多几日，京朝官制草案，早都撰拟脱稿。由评议课委员评议过，再由考定课委员加以考核。审定课委员悉心审定，才敢呈由编制大臣，经各编制大臣一律署诺，然后送往总司核定处删改具奏。
总核官制大臣庆亲王奕劻，瞿中堂鸿机，孙中堂家鼐，三个儿接到草案，不敢怠慢，打足精神，逐案逐案的瞧阅。见所拟官制，大抵依据端方等原奏，斟酌而成。为首是内阁，设总理大臣一人，左右副大臣二人。各部尚书，均为内阁政务大臣、参知政事。下设提调一，副提调一，置五局，是制诰局，庸勋局，编制局，统计局，印铸局。那武官考试处，就附设在庸勋局里头。各部督设尚书、左右侍郎各一人。只外务部仍设管部大臣一人，下设承政厅、参议厅、及参事、郎中主事、七品小京官、录事等员。视各部事务之繁简，以定额缺之多寡，是为各部通则。凡陆海军部、吏部以外各部，都是这么办法。各部的名称次第，首为外务部；次为民政部，即以巡警部改设，并将步军统领衙门所掌事务，及户礼工三部所掌有关民政各事并人；次为财政部，以户部财政处改设；次为陆军部，以兵部练兵处及太仆寺裁并改设；次为海军部，暂归陆军部办理；次为法部，以刑部改设，并以户部现审处所掌事务并人；次为学部，仍从旧制；次为农工商部，以商部工部归并设立；次为交通部；次为理藩部，以理藩院改设；次为吏部。此外并改政务处为资政院，升礼部为典礼院，改大理寺为大理院，都察院仍如旧制。
又设集贤院、审计院、行政裁判院，及军咨府等，共计十一部七院一府。
三位总核大臣瞧过之后，互相筹议。孙家鼐道：“内阁本是闲曹，经这么一改，冷署变成繁缺了。”
瞿鸿机道：“世变沧桑，何常之有？我朝入关之始，官制虽缘明朝旧制，以六部管行政，丙阁司票拟，且升大学士为正一品，但是彼时总枢机参密，勿的大半是天潢亲贵，丰沛故人。政柄操在武夫手里，虽有阁臣，不过黼黻承乎罢了。海宁陈之遴，溧阳陈名夏，且为了弄权植党，死的死，窜的窜。号为硕甫名臣的杜文端、冯文毅诸公，都不过仰亲贵鼻息，伴食中书过一辈子是了，天下安危，与他一毫都不相涉。等到圣祖以冲龄嗣位，那时候满汉之间，稍稍相习。辅政四贵臣，又皆因专横恣肆，不克令终。
三藩之变，天下几危，内发晁错之谋，外奏郭李之续的，又都出于汉臣。为了这么，汉大臣渐获信作。圣祖又留意文学，高江村、李昆山辈，皆以儒臣翰苑，与闻机密。世宗嗣服，承累洽重熙之后，挟雷霆万钧之威，旋乾转坤，与天下更始，悉化轸域之见。满汉才杰，并蒙委任。把内阁政柄，移入军机处。
鄂文端、张文和两公，并直枢府。那时候，一人独运于上，非惟汉大臣无所短长，就是满洲亲贵，也孜孜救过不暇。植党弄权，更非敢所设想了。高宗御极，强张两相，并受顾命，翊赞枢廷。鄂以儒臣登宰辅，矢志公忠。当时承平日久，满洲世族，渐流矜夸，鄂相深为恨嫉，所以引用的多是汉族寒素之士，一时物望碱归。那不得志的满人，夸毗无实的汉人，便都趋向桐城门下，朝士遂分为鄂张两党。鄂相早卒，鄂党遂归失敚张相为人，小廉曲谨，内结主知，而时以微词马下，测人主喜怒，以后于文襄和致斋，都承他的衣钵。嘉庆道光两朝，台阁风气，以不办一事为持重，不听一言为老成，雍容揖攘，百事就此丛脞了。本朝初制亲藩，不得与闻政事，雍正时光怡贤亲王辅政，出自特典，又作别论。嘉庆亲政，成哲亲王领军机大臣，那是为仁宗方在谅闇，仿古时冢宰听政之制。且当大奸初夷，籍以镇定人心，所以甫及百日就出去的。自从文宗弃天下，穆宗方在冲幼，恭亲王遂以议政王人领枢廷，政局为之一变。直到于今，沿而未革。”
孙家鼐道：“不必说了，这不过都是用人行政，微有出入，官制究未曾大改。现在这么，是把从前制度，根本推翻了。”
奕劻道：“推翻也罢，不是推翻也罢，那都是没要紧的事。我看这草案拟的还不很妥当，大家商量商量，怎么改它一下子！”
瞿孙两人齐说王爷所见极是。奕劻道：“依我主见，好好的礼部，何必改称典礼院？那行政裁判院、集贤院，添设得更没有道理。就是财政部、交通部，名儿题得也