后二人坐着，一面叫荣禄拨一支精健的人马，约有五百人，暗暗地保护着，从小路抄在皇帝金棺前，飞也似地赶进北京城。回到宫内，孝贞皇后与懿妃二人，赶进宫中，那肃顺等还在路上，未曾知道。孝贞皇后与懿妃就将恭亲王亲王先召进宫，将皇子载淳与他们见过，又拿出传国玉玺，给二位王爷瞧了，便又宣大学士周祖培、桂良、户部尚书沈兆麟，户部左侍郎文祥，右侍郎宾宝均，鸿肤寺少卿曹毓英，一班满汉心腹大臣，进宫去连夜密议。议定奉幼主载淳为皇帝改年号为同治元年。诸事议妥，第二天恭亲王派大队人马驻扎在大清门一带，以备迎接梓宫一面又在太和殿上，预备灯采，作为奉安梓宫百官行礼的地方。直到第三天上，那怡亲王载垣，大学士端华，先进城来。孝贞皇后吩咐把诏书向两人宣读，端华大声说道：“我等尚未进城，诏书从何而来？”
恭王道：“现在有传国玺在此。”
怡亲王又说道：“小王奉先帝遗旨监国摄政，如今皇子年幼，非我允许，无论太后贵妃，都无权召见大臣。”
怡亲王正说着，荣禄从后面出来，高声叫道：“恭亲王听旨，奉皇太后面谕，将载垣端华二人拿下。”
便有二十多名兵士，抢上前来，将怡亲王与端华擒住，又有侍卫上前，脱去二人的衣帽，押解下去，打入宗人府监狱里去了。这时肃顺正护送着皇帝的金棺，走到密云县的地方，亲王便秘密召了神机营大祥子大文子，星夜领兵，赶到密云去捉肃顺。他们赶到的时候，肃顺正在密云，打尖住宿，大卧室内，拥抱着两位姨太太，同睡在床上。听说亲王派人来捉他，他便咆哮如雷，在卧室中大骂那些神机营的兵，不由分说，打破房门，一拥上去，将肃顺捉住，带上手铐脚镣，押回北京。送交宗人府监禁。这里孝贞皇后与懿妃，同着同治皇帝，都是全身孝服，素车白马，出皇城大门迎接咸丰皇帝的金棺，奉安在太和殿，行礼举哀已毕。然后同治皇帝登极，受百官朝贺，封孝贞皇后为母后皇太后，又封懿妃为圣母皇太后。孝贞太后住在东面，因此宫中又称为东太后懿妃住在西面，因此宫中的人，又称为西太后。同治皇帝又下谕旨，定载垣，端华，肃顺一班人的罪，谕云：“载垣、端华、肃顺，朋比为奸，专权跋扈，种种情形，均经明降谕旨，宣示中外，至载垣，端毕，肃顺，于七月十七日，皇考升遐，即以赞襄王大臣自居，实则我皇考弥留之际，但面谕载垣等，立朕为皇太子，并无令其赞襄政事之谕，载垣乃造作赞襄名目，诸事并不请旨，擅自主持两宫皇太后面谕之事，亦敢阻违不行。御吏董元条奏皇太后垂帘事宜，载垣等非但擅改谕旨，并于召对时，有伊等系赞襄朕躬，不能听命于皇太后，伊等请皇太后看摺，亦属多余之语当面咆哮，目无君上，情形不一而足，且属言亲王等不可召见。意在离间，此载垣端华肃顺之罪状也。肃顺擅坐御位，于进内廷当差时，出入自由，目无法纪，擅用宫内御用品，于传取应用物件，抗违不遵旨，并自请分见两宫皇太后，于召对时，辞气之间，互相抑扬，意在挑衅，此又肃顺之罪状也。一切罪状，均经母后皇太后，圣母皇太后，面谕议政王军机大臣逐条开列，传知会议王大臣等知悉。兹据该王大臣等，按律拟罪，将载垣等凌迟处死，当即召见议政王奕诉，军机大臣户部左侍郎文祥，右侍郎宾均，鸿肤寺少卿曹毓英，惠亲王奕诉，亲王奕淙，钟郡王奕洽，孚郡王奕谏，睿亲王仁寿，大学士贾桢，周祖培，刑部尚书绵森，面谕以载垣等罪，不无一线可原。兹据该王大臣等佥称载垣，端华、肃顺跋扈不臣，均属罪大恶极，国法无可宽宥，并无异辞。朕念载垣等均属宗支，以身罹重罪，应悉弃市，能无泪下，惟载垣等前后一切专权跋扈情形，谋危社稷，是皆列祖列宗之罪人，非独欺朕躬为有罪也。在载垣未尝不自恃为顾命大臣纵使作恶多端，定邀宽典，岂知赞襄政务，皇考实无此谕。若不重治其罪，何以仰副皇考付托之重，亦何以饬法纪而示万世？即照该王大臣等所拟，均即凌迟处死。实属怙罪相当惟国家本有议亲议贵之条，尚可量从末减，姑于万无可宽贷之中，免其肆市。载垣端华均加恩赐令自尽，即派肃亲王华封，刑部尚书绵森，迅即往宗人府空室，传旨令其自尽，为国体起见，并非朕之私于载垣端华也，至肃顺之悖逆狂谬，较载垣等尤甚，亟应凌迟处死，以伸国去，而快人心惟朕心究有所不忍，着加恩改为斩立决，即派睿亲王仁寿，刑部右侍郎载龄，前往监视行刑以为大逆不道者戒，至景寿身为国戚，缄默不言，穆荫匡源杜翰焦佑瀛于载垣藕压政柄，不能力争，均属辜恩溺职，穆荫在军机大臣上行走已久，班次在前，情节尤重。该王大臣等拟请景寿、穆荫、匡源、杜翰、焦佑瀛等革职，发往新疆效力，均属罪有应得。惟以载垣等凶焰方张，受彼箝制，实有难与争衡之势，其不能振作，尚有可原。御前大臣景寿着即革职。仍留公爵并额驸品级，免其严遣。兵部尚书穆荫着即革职，发往军台效力赎罪。吏部左侍郎匡源，署礼部右侍郎杜翰，太仆寺少卿焦佑瀛，均着革职，加恩免其发遣。钦此。”
这一道上谕下来之